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PyTorch中的多维网格上的三次B样条插值

项目描述

torch-cubic-b-spline-grid

License PyPI Python Version CI codecov

在PyTorch中对多维网格进行三次B样条插值。

本软件包的主要目标是提供一个可学习的、连续的空间参数化,该空间为1-4D。


这是Warp中使用的模型的PyTorch实现,Warp用于在冷冻电镜图像中的连续变形场和局部可变光学参数。该方法在Dimitry Tegunov的论文中进行了描述[链接]

Warp中的许多方法都是基于1-3维空间的连续参数化。这种参数化是通过在粗略、均匀网格上的点之间进行样条插值来实现的,这计算效率很高。网格扩展到需要建模的每个维度。网格分辨率由每个维度中的控制点数定义,并根据物理约束(例如,帧数或像素数)和可用信号进行缩放。后者提供了正则化,以防止对稀疏数据使用过多参数的过拟合。当需要检索描述为网格的参数时(例如空间中的点(和时间)),例如对于粒子(帧),则在网格上的该点进行B样条插值。通常,为了拟合网格的参数,优化与网格上特定位置的插值相关的成本函数。

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