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小分子单晶X射线衍射数据筛选程序

项目描述

screen19

PyPI release Build status Supported Python versions Code style: black Language grade: Python Total alerts

小分子单晶X射线衍射数据筛选程序

作为用户安装

要使用screen19,您需要一个包含DIALS的Python环境。安装DIALS的说明可以在此处找到。然后您可以使用以下命令安装screen19:

libtbx.pip install screen19

作为开发者安装

如果您想开发screen19,请检出仓库的本地副本,并使用以下命令安装:

git clone git@github.com:xia2/screen19.git
libtbx.pip install -e screen19

然后您需要重新构建libtbx以获取screen19调度程序。

变更日志

Screen19 0.213 (2022-09-29)

错误修复

  • 修复了screen19在尝试细化找到的晶格的不同可能的布拉维设置时失败的情况。这是由于screen19在执行细化之前未能过滤掉具有零变化观测中心位置的反射,导致这种情况发生。(#53

  • 修复screen19和screen19.minimum_exposure的帮助信息。#58

弃用和移除

  • screen19不再支持DIALS 2.2或Python 2.7。为了安装screen19,建议您首先安装DIALS版本3.4或更高版本。#52

杂项

screen19 0.212(2020-10-12)

更新screen19以与python-procrunner版本2.1.x中的上游API更改兼容。python-procrunner

杂项

screen19 0.211(2020-08-19)

杂项

  • screen19调用dials.integrate代码的方式已更改,以适应DIALS中的代码更改。

    (#31)

screen19 0.210(2020-06-26)

错误修复

  • 向源发布中添加缺少的文件

screen19 0.209(2020-06-25)

错误修复

  • 默认情况下,现在抑制了来自French-Wilson计算的某些过于冗长的日志信息。如果您想查看它们,可以通过以调试模式运行screen19来查看。

    screen19 verbosity=1 <other arguments>

    (#30)

screen19 0.208(2020-06-25)

特性

  • screen19现在支持DIALS 3和DIALS 2.2。

    DIALS在此可用.

    • DIALS 3是最新主要版本,并受到积极支持。目前仅支持Python 3.6。

    • DIALS 2.2是长期支持版本。它仅接收错误修复,并且将在2020年底停止支持。它支持Python 2.7和3.6。

    • DIALS 1.14不再处于积极开发状态,并且screen19对它的支持已被撤回。#25

错误修复

  • 在执行Wilson图分析之前,对积分强度执行French-Wilson缩放。这修复了screen19在数据由少量衍射组成的情况下失败的情况。#29

项目详情


下载文件

下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源分布

screen19-0.213.tar.gz (26.9 KB 查看散列

上传时间

构建分布

screen19-0.213-py3-none-any.whl (24.9 KB 查看散列

上传时间 Python 3

支持

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