功能团丰度的XANES量化
项目描述
QUANTORXS是一个开源程序,用于自动分析碳、氮和氧K边XANES光谱,以量化功能团的浓度和元素比率(N/C和O/C)。它基于发表在分析化学上的新型量化方法。
QUANTORXS自动执行以下任务
从文件(夹)加载数据
去除背景
归一化光谱
生成精细结构模型并将其拟合到实验数据
从拟合结果计算功能团丰度和元素比率
生成包含结果和归一化光谱文件的Excel文件和多个图。
以下图表详细说明了此过程
替代文本
QUANTORXS设计为无需任何用户输入(除了实验光谱)即可运行。愿意修改定量细节的用户可以从其GitHub仓库下载代码。
该代码最初由Corentin Le Guillou编写。Francisco de la Peña创建了命令行和图形用户界面。
安装QUANTORXS。
QUANTORXS是用Python编程语言编写的,可在pypi上获得。它可以在安装了Python编程语言的任何操作系统上运行。
要在终端中安装QUANTORXS,请执行以下操作
pip install quantorxs
Windows用户的分步安装说明
如果您对Python不熟悉,我们建议您首先为您的平台安装开源免费的Anaconda Python发行版。之后,从Microsoft Windows的开始菜单中,打开“anaconda提示”
替代文本
然后输入以下内容并按Enter键(需要连接到互联网)
pip install quantorxs
替代文本
这就完成了!QUANTORXS现在应该已安装在您的系统中。
启动QUANTORXS图形用户界面
要启动图形界面,请在终端中执行quantorxs_gui(例如)。或者,Windows用户可以通过在开始菜单中搜索可执行文件“quantorxs_gui”并按照下面的图片启动它来启动它。
替代文本
如何使用图形界面
该程序设计为一次处理多个光谱。所有源光谱应组装在一个文件夹中。QUANTORXS只读取由aXis2000产生的格式
单击选择数据目录按钮,并选择包含源光谱的文件夹。
输入一个输出文件夹名称(相对于数据目录),用于存储分析结果。默认为QUANTORXS结果。
确保未选中demo框。如果选中,它使用默认文件作为输入以生成输出文件的示例。
选择图形输出的格式(默认为SVG)
如果需要,设置偏移量以补偿所有光谱中的任何能量错位(例如,来自校准不良的单色仪)。
单击运行按钮并等待分析完成(通常每个光谱几秒钟)。
替代文本
输出文件的说明
输出文件夹将在提取数据的文件夹中创建。创建一个.xls结果文件和两个不同的子文件夹
a .xls文件包含多个工作表
拟合参数
量化数据(芳烃、酮、脂肪族、羧酸;以及N/C和O/C比率)和一些相关图形
C-K边缘通过面积比法归一化的光谱
N-K边缘通过面积比法归一化的光谱
O-K边缘通过面积比法归一化的光谱
C-K边缘基于面积的归一化中高斯拟合的高度
N-K边缘基于面积的归一化中高斯拟合的高度
O-K边缘基于面积的归一化中高斯拟合的高度
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包含每个归一化光谱.txt文件的文件夹
显示图形的文件夹
横截面拟合
归一化光谱
解卷积(包括所有高斯)
项目详情
quantorxs-0.1.1.tar.gz 的散列值
算法 | 散列摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | b6164c563d3b926c3351cc03b41f2a6c418329d1ea7f2807c5d917de3bca9032 |
|
MD5 | 990902ae6c2e23fb1573c1ec2109eac7 |
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BLAKE2b-256 | 65d46b764ed5fbd8fe319cb6a3f654d4a87ed6e01c625181b8ab1f2775d6151e |