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功能团丰度的XANES量化

项目描述

QUANTORXS是一个开源程序,用于自动分析碳、氮和氧K边XANES光谱,以量化功能团的浓度和元素比率(N/C和O/C)。它基于发表在分析化学上的新型量化方法。

QUANTORXS自动执行以下任务

  • 从文件(夹)加载数据

  • 去除背景

  • 归一化光谱

  • 生成精细结构模型并将其拟合到实验数据

  • 从拟合结果计算功能团丰度和元素比率

  • 生成包含结果和归一化光谱文件的Excel文件和多个图。

以下图表详细说明了此过程

Sequence of operations performed by the program

替代文本

QUANTORXS设计为无需任何用户输入(除了实验光谱)即可运行。愿意修改定量细节的用户可以从其GitHub仓库下载代码。

该代码最初由Corentin Le Guillou编写。Francisco de la Peña创建了命令行和图形用户界面。

安装QUANTORXS。

QUANTORXS是用Python编程语言编写的,可在pypi上获得。它可以在安装了Python编程语言的任何操作系统上运行。

要在终端中安装QUANTORXS,请执行以下操作

pip install quantorxs

Windows用户的分步安装说明

如果您对Python不熟悉,我们建议您首先为您的平台安装开源免费的Anaconda Python发行版。之后,从Microsoft Windows的开始菜单中,打开“anaconda提示”

where to find anaconda prompt

替代文本

然后输入以下内容并按Enter键(需要连接到互联网)

pip install quantorxs
The install command line

替代文本

这就完成了!QUANTORXS现在应该已安装在您的系统中。

启动QUANTORXS图形用户界面

要启动图形界面,请在终端中执行quantorxs_gui(例如)。或者,Windows用户可以通过在开始菜单中搜索可执行文件“quantorxs_gui”并按照下面的图片启动它来启动它。

where to find quantorxs

替代文本

如何使用图形界面

该程序设计为一次处理多个光谱。所有源光谱应组装在一个文件夹中。QUANTORXS只读取由aXis2000产生的格式

  • 单击选择数据目录按钮,并选择包含源光谱的文件夹。

  • 输入一个输出文件夹名称(相对于数据目录),用于存储分析结果。默认为QUANTORXS结果

  • 确保未选中demo框。如果选中,它使用默认文件作为输入以生成输出文件的示例。

  • 选择图形输出的格式(默认为SVG)

  • 如果需要,设置偏移量以补偿所有光谱中的任何能量错位(例如,来自校准不良的单色仪)。

  • 单击运行按钮并等待分析完成(通常每个光谱几秒钟)。

The graphical user interface

替代文本

输出文件的说明

输出文件夹将在提取数据的文件夹中创建。创建一个.xls结果文件和两个不同的子文件夹

a .xls文件包含多个工作表

  • 拟合参数

  • 量化数据(芳烃、酮、脂肪族、羧酸;以及N/C和O/C比率)和一些相关图形

  • C-K边缘通过面积比法归一化的光谱

  • N-K边缘通过面积比法归一化的光谱

  • O-K边缘通过面积比法归一化的光谱

  • C-K边缘基于面积的归一化中高斯拟合的高度

  • N-K边缘基于面积的归一化中高斯拟合的高度

  • O-K边缘基于面积的归一化中高斯拟合的高度

Analysis parameters

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Quantified data

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normalized spectra

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fitted gaussians

替代文本

包含每个归一化光谱.txt文件的文件夹

显示图形的文件夹

  • 横截面拟合

  • 归一化光谱

  • 解卷积(包括所有高斯)

项目详情


下载文件

下载适用于您的平台的文件。如果您不确定该选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源分发

quantorxs-0.1.1.tar.gz (78.2 kB 查看散列值)

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