pysrim-docker

PySRIM的Docker执行器

入门指南

要使用此包，只需将您的SR或TRIM导入替换为来自srim.docker的导入，例如：

from srim.docker import TRIM

trim = TRIM(...)

默认情况下，pysrim-docker使用costrouc/srim Docker镜像，并将输入和输出文件写入临时目录。

它是如何工作的？

pysrim-docker覆盖了SR和TRIM类的run()方法，使用一个在特定Docker镜像中执行bash脚本的实现。这个脚本只是将输入复制到适当的目录，运行所需的二进制文件，并返回结果。

为什么？

自从使用Docker以来，我看到了它在隐藏复杂的构建步骤背后的简单容器镜像中的实用性。然而，我更喜欢编写可能是分析流程一部分的代码，而不是独立的Python模块，因此最好在主机上执行输入文件生成。这个方法的另一个好处是，可以独立于Docker镜像更新安装。