为pymmcore-plus提供的MDA编写器
项目描述
pymmcore-MDA-writers
此包为pymmcore-plus提供编写器。在撰写此内容时,pymmcore-plus提供了保存图像的钩子,但没有实现保存图像的任何机制(有关更新,请查看https://github.com/tlambert03/pymmcore-plus/pull/29)。目前提供的是
- 一个简单的多文件TIFF编写器 - 可用
tifffile
加载 - 一个简单的Zarr编写器 - 不是ome-zarr
pip install pymmcore-mda-writers
(这需要至少pymmcore-plus >=0.4.0,该版本尚未发布。您可以使用pip install git+https://github.com/tlambert03/pymmcore-plus
安装一个可用的版本)
您需要添加到脚本中的所有内容是
# tiff writer
writer = SimpleMultiFileTiffWriter("data/tiff_writer_example/run")
# zarr writer
writer = ZarrWriter("data/zarr_writer_example/run", img_shape=(512, 512), dtype=np.uint16)
有关完整示例,请参阅示例文件夹。
项目详情
下载文件
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源分布
pymmcore_MDA_writers-0.5.0.tar.gz (11.4 kB 查看哈希)
构建分布
关闭
pymmcore_MDA_writers-0.5.0.tar.gz 的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | b6023c3ce9415277f3f70fc044f0458c0e241349bbbac4a96a73f884f093f34a |
|
MD5 | bf61676c9a5e97ded094f6fd6bc9019a |
|
BLAKE2b-256 | eaf12382c81bec6e68f5d3466b1a2909385b3d90211f5a78202d573a7df464bb |
关闭
pymmcore_MDA_writers-0.5.0-py2.py3-none-any.whl 的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 868b53cd0039d6f3bf649850061beb38138e196493d88a79282881508b0024ed |
|
MD5 | 53bacd848b7e5c6f5a214c5d0d989cde |
|
BLAKE2b-256 | c7160f544775e1cc8079d6e2a3c5b4ee86cc4e968cea64212ebc41cc9f23e742 |