高通量淋巴细胞受体测序数据处理生物信息学工具包。
项目描述
pRESTO - REpertoire Sequencing Toolkit
pRESTO 是一个用于处理 B 细胞和 T 细胞库高通量测序原始读数的工具包。
高通量测序技术的显著改进现在使得大规模描述淋巴细胞库成为可能，淋巴细胞库是指位于 B 细胞和 T 细胞表面的跨膜抗原受体蛋白的集合。REpertoire Sequencing Toolkit (pRESTO) 包含一系列工具，用于处理在基因库段分配之前的所有序列处理阶段。pRESTO 设计用于处理单端读数或双端读数。它包括质量控制、引物屏蔽、带嵌入序列条码的读数注释、生成唯一分子标识符 (UMI) 一致序列、双端读数组装和重复序列识别等功能。还包含多种序列排序、采样和转换操作的选项。
关闭
presto-0.7.2.tar.gz 的散列
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | b4f4b34413af4207eb2052316d31d7bc2067b864286498476d89013ad5423dd9 |
|
| MD5 | e01144b735a6cba7d210ef7fe91525da |
|
| BLAKE2b-256 | 55dfb9ef6ef83741f82a24cb2426c1186a3d1df8d553d168bb14d2fbbe532e17 |
