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基于Parquet的scverse数据结构的序列化

项目描述

PyPi version

pqdata

基于Parquet的实验性I/O用于scverse数据结构。

安装

pip install pqdata
# or
pip install git+https://github.com/gtca/pqdata

[!WARNING] 此软件包为实验性,API可以在版本之间以及文件结构中更改。

动机

TODO

功能和集成

TODO

I/O

示例笔记本. 使用pqdata的I/O操作如下

from pqdata import write_anndata, write_mudata
write_anndata(adata, "pbmc3k_anndata.pqdata")
write_mudata(mdata, "pbmc5k_citeseq_mudata.pqdata")

from pqdata import read_anndata, read_mudata
adata = read_anndata("pbmc3k_anndata.pqdata")
mdata = read_mudata("pbmc5k_citeseq_mudata.pqdata")

项目详情


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源代码分布

pqdata-0.1a1.tar.gz (10.9 kB 查看哈希值)

上传时间 源代码

构建分布

pqdata-0.1a1-py3-none-any.whl (10.7 kB 查看散列值)

上传时间 Python 3

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