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scverse生态系统中的扰动分析。

项目描述

Black Build codecov License PyPI Python Version Read the Docs Test PyPI

pertpy

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安装

我们建议在最新的Linux版本(例如Ubuntu 24.04 LTS)上安装和运行pertpy。除了标准的笔记本电脑外,不需要特定的硬件。

您可以通过pipPyPI在不到一分钟的时间内安装pertpy

pip install pertpy

如果您想使用scCODA或tascCODA,请按以下步骤安装pertpy

pip install 'pertpy[coda]'

如果您想使用差异基因表达接口,请运行以下命令安装pertpy

pip install 'pertpy[de]'

参考文献

Lukas Heumos, Yuge Ji, Lilly May, Tessa Green, Xinyue Zhang, Xichen Wu, Johannes Ostner, Stefan Peidli, Antonia Schumacher, Karin Hrovatin, Michaela Mueller, Faye Chong, Gregor Sturm, Alejandro Tejada, Emma Dann, Mingze Dong, Mojtaba Bahrami, Ilan Gold, Sergei Rybakov, Altana Namsaraeva, Amir Ali Moinfar, Zihe Zheng, Eljas Roellin, Isra Mekki, Chris Sander, Mohammad Lotfollahi, Herbert B. Schiller, Fabian J. Theis bioRxiv 2024.08.04.606516; doi: https://doi.org/10.1101/2024.08.04.606516

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源代码发行版

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上传时间 源代码

构建发行版

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上传时间 Python 3

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