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PartSegCore编译后的后端,

项目描述

PartSegCore_compiled_backend

Contributions Wheels PyPI version Anaconda-Server Badge Python Version Documentation Status Publication DOI

这是一个包含ParSeg所有cython/c++后端的包

当前版本从PartSegCore模块提取,以避免为主包构建多个轮子并加快测试速度。

此包需要libomp进行构建。在Linux上,可以使用apt install libomp-devyum install libomp-devel进行安装。在macOS上,可以使用brew install libomp进行安装。

由于目前在macOS ARM64上没有轮子,因此需要从源代码构建包。

例如

export OMP="$(brew --prefix libomp)"
pip install .

由于目前没有macOS ARM64的轮子,因此需要从源代码构建包。

引用方式

Bokota, G., Sroka, J., Basu, S. et al. PartSeg:一个用于从3D显微镜图像进行定量特征提取的工具。BMC生物信息学22,72(2021)。[https://doi.org/10.1186/s12859-021-03984-1](https://doi.org/10.1186/s12859-021-03984-1)

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