PartSeg

PartSeg是一个用于分割算法的图形用户界面和库。PartSeg还提供了napari插件，用于IO和标签测量。

此应用程序旨在帮助生物学家进行基于阈值和连通组件的分割。

教程

• 教程： 第1号染色体（作为GUI） 链接
• 第1号染色体教程数据 链接
• 教程： 不同神经元类型（作为库） 链接

安装

• 从二进制文件安装

  • Windows（基于Windows 10构建）
  • Linux（基于Ubuntu 20.04构建）
  • macOS（基于macOS 13构建）
  • macOS arm（基于macOS 14构建）在macOS上报告了权限系统的问题。如果您在启动应用程序时遇到问题，请尝试从终端运行它。

• 使用pip

  • 从pypi： pip install PartSeg[all]
  • 从存储库： pip install git+https://github.com/4DNucleome/PartSeg.git

• 使用conda

  • conda install -c conda-forge partseg
  • mamba install -c conda-forge partseg - 因为mamba比conda快

• 使用napari

  如果您不知道如何在系统上设置Python环境，您可以使用napari来运行PartSeg。它是一个科学图像分析的GUI。PartSeg也是napari的一个插件，因此可以从插件对话框中安装。要安装napari捆绑包，请下载它 napari捆绑包 并遵循 安装说明。

安装故障排除信息可在wiki中找到： wiki。如果此信息不能解决问题，您可以打开 问题。

Qt 6支持

PartSeg开发分支支持（从0.15.0开始稳定）具有实验性的Qt6支持。测试通过，但并非所有GUI代码都由测试覆盖。如果您发现任何问题，请报告。

运行

如果您下载了二进制文件，请在PartSeg文件夹内运行PartSeg（对于Windows，则为PartSeg.exe）文件。

如果您从存储库或pip安装，您可以使用PartSeg命令或python -m PartSeg运行它。第一个选项在Windows上不起作用。

PartSeg导出一些命令行选项

• --no_report - 禁用错误报告
• --no_dialog - 禁用错误报告和错误对话框。仅在从终端运行时使用。
• roi - 跳过启动器并开始ROI分析 GUI
• mask- 跳过启动器并开始ROI掩码 GUI

napari插件

PartSeg提供了napari插件，允许在napari查看器中读取项目格式。

保存格式

保存的项目是使用gzip或bz2压缩的tar文件。

元数据保存在data.json文件中（json格式）。图像/掩码以*.npy（numpy数组格式）保存。

界面

启动器。选择您要启动的程序

分割分析的窗口

分割分析的窗口，查看测量结果

创建一组测量的窗口

掩码分割的主窗口

实验室

功能基因组学和结构基因组学实验室 http://4dnucleome.cent.uw.edu.pl/

引用方式

Bokota, G.，Sroka, J.，Basu, S.等。PartSeg：为初学者设计的从3D显微镜图像中提取定量特征的工具。BMC生物信息学22，72（2021）。https://doi.org/10.1186/s12859-021-03984-1

变更日志

本文件将记录本项目的所有重大更改。

0.15.4 - 2024-09-27

🚀 功能

• 添加图像元数据的预览（#1154）
• 添加使用求和和最大值合并通道的选项（#1159）
• 添加napari小部件形式的元数据查看器（#1195）
• 从*.czi元数据中读取通道颜色（#1198）
• 将图像颜色用于添加到napari的图层（#1200）

🐛 错误修复

• 修复napari 0.5.0中对自定义标签颜色的选择问题（#1138）
• 添加pint调用以强制初始化单位注册表（#1146）
• czifile中缺少zsd支持的解决方案（#1142）
• 修复准备数据用于mahotas.haralick的代码以避免溢出问题（#1150）
• 将分割算法中的use_convex类型从int更改为bool（#1152）
• 防止传播用户设置的递减对比度限制（#1166）
• 如果不存在组件，防止在搜索组件时出错（#1167）
• 修复检查由MeasurementProfile请求的通道是否存在的问题（#1165）
• 修复尝试从编辑窗口访问刚刚删除的测量配置文件的问题（#1168）
• 修复检查调查文件的代码中的错误（#1174）
• 修复插件发现中的错误，以便在napari查看器中注册它们（#1175）
• 修复自动生成的小部件范围设置问题（#1187）
• 修复从单通道czi文件中读取通道名称的问题（#1194）

🚜 重构

• 在测试中将警告视为错误（#1192）
• 合并Image类的所有通道特定属性（#1191）

📚 文档

• 更改主页URL（#1139）
• 添加macOS arm bundle下载链接（#1140）
• 添加0.15.4版本发布变更日志
• 更新变更日志（#1176）

🧪 测试

• [自动] 约束升级：napari、sentry-sdk、sympy（#1128）
• [自动] 约束升级：mahotas、numpy、sentry-sdk、sympy（#1145）
• [自动] 约束升级：numpy、tifffile（#1163）
• [自动] 约束升级：napari、sentry-sdk、tifffile（#1169）
• [自动] 约束升级：magicgui、sentry-sdk（#1172）
• [自动] 约束升级：sympy、tifffile（#1177）
• [自动] 约束升级：imageio、napari、numpy（#1180）
• 约束升级：sentry-sdk和修复测试（#1182）
• napari==0.5.3相关修复，约束升级：imageio、ipython、numpy、qtconsole、scipy、simpleitk、tifffile（#1183）
• [自动] 约束升级：numpy、pydantic（#1188）
• [自动] 约束升级：imagecodecs，pandas，pydantic，sentry-sdk，sympy，tifffile （#1190）

⚙️ 其他任务

• 使用 tox-uv 加速测试（#1141）
• 从PR分支获取额外的字典以检查PR标题（#1144）
• 放宽numpy约束（#1143）
• 允许跳过拼写检查PR标题（#1147）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（#1149）
• 在Azure管道上仅创建包含版本名的存档（#1151）
• 修复来自仓库的napari测试（#1148）
• 使用python 3.11确定PR描述中的更新包（#1160）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（#1164）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（#1170）
• 由于脆弱且未使用，禁用napari层中的缩略图生成（#1171）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（#1173）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（#1178）
• 修复调用logger以正确传递参数到消息（#1179）
• 通过启用隐藏文件上传来修复上传覆盖率文件（#1186）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（#1184）
• 在预测试中使用PyQt6（#1196）
• 添加#1191中遗漏的代码（#1197）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（#1189）
• 在更新依赖关系的PR中自动添加“跳过检查PR标题”标签（#1199）

构建

• 由于与numpy不兼容，从依赖项中删除PyOpenGL-accelerate（#1155）
• 更新numpy和qt包的安装约束（#1157）
• 强制使用napari 0.5.0以进行Qt6绑定（#1161）
• 仅对python 3.9+要求napari>=0.5.0（#1162）

0.15.3 - 2024-07-08

🚀 功能

• Pydantic 2兼容性（#1084）

🐛 错误修复

• 修复颜色映射预览中渲染图标（#1040）
• 修复sentry-sdk 2.0发布中消息验证长度的测试（#1098）
• 修复读取器检查的修复以检查小写扩展名以验证兼容性（#1097）
• 修复napari 0.5.0兼容性（#1116）

🚜 重构

• 修复Qt标志（#1041）
• 修复roi掩码代码中的qt标志（#1042）
• 修复roi分析中的qt标志（#1043）
• 从setup.cfg迁移到pyproject.toml（#1070）

📚 文档

• 允许使用build文档依赖项的新版本（#1057）

🧪 测试

• [自动] 约束升级：imagecodecs，imageio，ipykernel，ipython，numpy，oiffile，pandas，psygnal，pyinstaller，qtconsole，qtpy，sentry-sdk，simpleitk，superqt，tifffile，xlsxwriter （#1020）
• [自动] 约束升级：h5py、imageio、ipython、numpy、packaging、pydantic、pyinstaller、pyqt5、scipy、sentry-sdk、superqt、tifffile、xlsxwriter （#1027）
• [自动] 约束升级：imageio、magicgui、xlsxwriter （#1030）
• [自动] 约束升级：ipykernel、pandas、qtpy （#1032）
• [自动] 约束升级：imageio、ipykernel、ipython、numpy、pandas、psygnal、pygments、pyinstaller、qtconsole、scipy、sentry-sdk、simpleitk （#1035）
• [自动] 约束升级：imagecodecs、imageio、ipykernel、magicgui、pandas、pyinstaller、qtawesome、sentry-sdk、tifffile （#1048）
• [自动] 约束升级：ipykernel、numpy、pandas、partsegcore-compiled-backend、pydantic、scipy、sentry-sdk （#1058）
• 改进 PartSegImage 的测试（#1072）
• 改进 PartSegCore 的测试套件（#1077）
• [自动] 约束升级：imageio、ipykernel、local-migrator、napari、numpy、pandas、partsegcore-compiled-backend、pyinstaller、sentry-sdk、tifffile、vispy、xlsxwriter （#1063）
• [自动] 约束升级：magicgui、packaging、psygnal、pyinstaller、sentry-sdk、superqt （#1086）
• [自动] 约束升级：psygnal、pydantic、sentry-sdk、vispy （#1090）
• [自动] 约束升级：h5py、ipykernel、mahotas、pandas、psygnal、pydantic、pyinstaller、qtawesome、scipy、sentry-sdk、superqt （#1092）
• [自动] 约束升级：imageio、tifffile （#1100）
• [自动] 约束升级：pydantic、sentry-sdk、superqt、tifffile （#1102）
• [自动] 约束升级：psygnal、pygments、qtconsole、sentry-sdk、superqt、tifffile （#1105）
• [自动] 约束升级：imagecodecs、magicgui、oiffile、openpyxl、packaging、pydantic、pyinstaller、requests、scipy、sentry-sdk、superqt、sympy、tifffile、vispy （#1107）
• [自动] 约束升级：pydantic （#1112）

⚙️ 其他任务

• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#1019）
• 删除插件页面预览，因为它不再维护 （#1021）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#1022）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#1026）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#1031）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#1034）
• 使用新的 semgrep 配置 （#1039）
• 上传原始覆盖率信息 （#1044）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#1036）
• 在单独的步骤中运行覆盖率上传 （#1053）
• 在 Tests 工作流程中生成本地报告，并使用适当的脚本获取报告 （#1054）
• 将覆盖率移动回主工作流程（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1055](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1055)#1055》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1056](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1056)#1056》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1059](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1059)#1059》）
• 更新 actions/upload-artifact 和 actions/download-artifact 从 3 到 4（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1062](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1062)#1062》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1064](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1064)#1064》）
• 组动作更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1065](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1065)#1065》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1068](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1068)#1068》）
• 移除向 codecov.io 上传 2 个构建的需求（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1073](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1073)#1073》）
• 重新添加测试到覆盖率报告中（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1074](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1074)#1074》）
• 在工作流程中从 setup.cfg 切换到 pyproject.toml（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1076](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1076)#1076》）
• 修复 pyinstaller 预依赖编译问题（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1075](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1075)#1075》）
• 将 codespell 添加到 pre-commit 并修复指出的错误（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1078](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1078)#1078》）
• 添加新的 ruff 规则并应用它们（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1079](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1079)#1079》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1080](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1080)#1080》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1081](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1081)#1081》）
• 修复升级依赖项工作流程（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1083](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1083)#1083》）
• 在预测试中阻止使用 mpmath==1.4.0a0 和 sentry-sdk 2.0.0a1/a2（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1085](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1085)#1085》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1089](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1089)#1089》）
• 通过使用约束修复 jupyter 失败的测试（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1093](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1093)#1093》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1091](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1091)#1091》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1096](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1096)#1096》）
• 添加 python 3.12 测试（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1087](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1087)#1087》）
• 从测试中排除 python 3.11 和 3.12 上的 pyside2（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1099](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1099)#1099》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1101](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1101)#1101》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1103](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1103)#1103》）
• 将 macos 运行器升级到 macos-13（包括 azure 和 GHA）（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1113](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1113)#1113》）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1108](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1108)#1108》）
• 从约束中移除 pyqt5（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1118](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1118)#1118》）
• 添加来自 GHA 的发布工作流程（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1117](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1117)#1117》）
• 将 actionlint 添加到 CI 中以提前防止 GitHub 工作流程中的错误（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1119](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1119)#1119》）
• 修复发布工作流程，通过更新权限
• 检查发布说明是否已正确创建（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1122](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1122)#1122》）
• 在检查新版本时正确使用 enum（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1123](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1123)#1123》）
• 重构和简化菜单栏创建，为 macOS numpy 问题添加解决方法（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1124](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1124)#1124》）
• 简化发布工作流程（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1126](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1126)#1126》）
• 修复 make_release.yml 以正确检测发布，尝试 3（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1127](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1127)#1127》）

🛡️ 安全性

• (依赖项) 将 actions/checkout 从 3 升级到 4（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1029](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1029)#1029》）
• (依赖项) 将 conda-incubator/setup-miniconda 从 2 升级到 3（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1038](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1038)#1038》）
• (依赖项) 将 aganders3/headless-gui 从 1 升级到 2（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1047](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1047)#1047》）
• (依赖项) 将 actions/checkout 从 3 升级到 4（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1045](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1045)#1045》）
• (依赖项) 将 hynek/build-and-inspect-python-package 从 1 升级到 2（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1050](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/1050)#1050》）
• (依赖项) 将 actions/setup-python 从 4 升级到 5 (#1046)
• (依赖项) 将 github/codeql-action 从 2 升级到 3 (#1051)
• (依赖项) 将 peter-evans/create-pull-request 从 5 升级到 6 (#1067)
• (依赖项) 将 codecov/codecov-action 从 3 升级到 4 (#1066)

构建

• 修复未捆绑 Font Awesome 6 Free-Solid-900.otf 文件到可执行文件的问题 (#1114)
• 更新说明和发布说明，指向 GitHub 发布版本 (#1115)
• 在创建捆绑包时，不要重复创建存档 (#1120)
• 启用 macOS-arm 捆绑包构建 (#1121)

0.15.2 - 2023-08-28

🐛 错误修复

• 修复算法的范围阈值选择 (#1009)
• 在运行批处理时，检查文件扩展名是否受加载器支持 (#1016)
• 不允许选择和渲染损坏的批处理计划 (#1015)

🧪 测试

• [自动] 约束升级：imagecodecs、ipykernel、magicgui、psygnal、scipy、superqt、tifffile (#1011)
• [自动] 约束升级：imageio、pyinstaller、tifffile (#1018)

⚙️ 其他任务

• 使用更快的 black 版本 (#1010)
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 (#1013)

0.15.1 - 2023-08-08

🚀 功能

• 允许将多个 napari 图像层保存到单个 tiff 文件中 (#1000)
• 添加导出包含数据的批处理项目的选项 (#996)

🐛 错误修复

• 修复 PartSeg 捆绑包中双重注册 napari 插件的可能问题 (#974)
• 为部分测试工作流程升级操作系统版本 (#977)
• 为主测试工作流程升级操作系统版本 (#979)
• 确保模块 PartSegCore.channel_class 存在于捆绑包中 (#980)
• 降低 npe2 架构版本以与较旧的 napari 版本兼容 (#981)
• 按平台生成测试报告 (#978)
• 在捆绑包中导入插件时保持正确的模块名称 (#983)
• 修复 napari 仓库工作流程 (#985)
• 修复在轴上有双 Q 但与虚拟维度相关的读取 tiff 文件中的错误 (#992)
• 修复导致将计算计划保存到 excel 文件时状态损坏的错误 (#995)
• 在 CI 上启用 python 3.11 测试，修复小错误 (#869)

🧪 测试

• [自动] 约束升级：imageio、ipython、psygnal、scipy、sentry-sdk (#975)
• [自动] 约束升级：h5py、imagecodecs、imageio、ipykernel、napari、numpy、pandas、pydantic、pyinstaller、scipy、sentry-sdk、tifffile、vispy (#986)
• [自动] 约束升级：imagecodecs、sentry-sdk、tifffile (#997)
• [自动] 约束升级：ipykernel、pydantic （#1002）
• [自动] 约束升级：numpy、pygments、sentry-sdk、superqt （#1007）

⚙️ 其他任务

• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#973）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#982）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#987）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#988）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#991）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#998）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#1004）
• 将 markdown 检查器从 pre-commit 更改为 mdformat （#1006）
• [pre-commit.ci] pre-commit 自动更新 （#1008）

0.15.0 - 2023-05-30

🚀 功能

• 添加对环境变量 PARTSEG_SENTRY_URL 的支持以及关于错误报告的基本文档（《#802》）
• 允许在因异常导致的警告中查看底层异常（《#829》）
• 添加体素大小测量，并允许批量覆盖体素大小（《#853》）
• 添加对 Qt6 的 alpha 支持（《#866》）
• 添加与 z 轴一起创建投影的选项（《#919》）
• 添加 napari 图像自定义表示，以便通过 sentry 进行更好的错误报告（《#861》）
• 添加标签和色图导入/导出操作（《#936”）
• 实现用于颜色图和标签控制的 napari 小部件（《#935”）
• 为多个文件小部件添加“忘记所有”按钮（《#942”）
• 在单个组件发生异常时，不要终止整个掩膜分割项目的处理（《#943”）
• 将基于距离的流域添加到流动方法（《#915”）
• 为所有算法组添加 napari 小部件（《#958”）
• 添加 napari 小部件以沿 z 轴复制标签（《#968”）

🐛 错误修复

• 在异常对话框中打印所有异常而不是最新的一个（《#799”）
• 修复 ROIExtractionResult 的 __str__ 和 __repr__，使用 ROIExtractionResult 而不是 SegmentationResult（《#810”）
• 修复代码以解决 napari 仓库中的更改（《#817”）
• 修复多行小部件的调整大小问题（《#832”）
• 修复 tox 配置以运行所有必需的测试（《#840”）
• 修复 GUI 中 MSO step_limit 描述（《#843”）
• 修复 python 3.9.7 的 redefined-while-unused 导入代码（《#844”）
• 修复 Deepsource 报告的警告（《#846”）
• 确保“ROI”层在正确的位置以便正确可视化（《#856”）
• 修复 napari 小部件的测试（《#862”）
• 修复针对新 psygnal 版本的捆绑构建（《#863”）
• 修复最小需求管道（《#877”）
• 更新pyinstaller配置（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/926](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/926)#926》）
• 在colormap和标签列表中使用文本图标，而不是位图图标（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/938](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/938)#938》）
• 解决测试自定义保存对话框时的警告（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/941](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/941)#941》）
• 将组件编号加载到ROI GUI时添加填充零（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/944](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/944)#944》）
• 正确计算watershed napari小部件的边界（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/969](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/969)#969》）
• 修复在napari贡献中保存轴顺序错误的bug（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/972](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/972)#972》）

🚜 重构

• 简化并重构github工作流程（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/864](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/864)#864》）
• 在Roi Analysis中更好地加载Mask项目（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/921](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/921)#921”）
• 在pylint: disable中使用更具描述性的名称（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/922](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/922)#922”）
• 删除pkg_resources的使用，因为它已过时（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/967](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/967)#967”）
• 将napari插件转换为npe2（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/966](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/966)#966”）

📚 文档

• 更新README和项目元数据（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/805](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/805)#805”）
• 为PartSeg 0.15.0创建发布说明（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/971](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/971)#971”）

🎨 样式

• 将默认主题更改为暗色，启动时移除闪烁的窗口（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/809](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/809)#809”）

🧪 测试

• [自动] 依赖项升级：packaging、pyinstaller、pyopengl-accelerate、tifffile、xlsxwriter（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/932](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/932)#932”）
• [自动] 约束升级：fonticon-fontawesome6、imageio、numpy、partsegcore-compiled-backend、pygments、sentry-sdk（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/937](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/937)#937”）
• [自动] 约束升级：imageio、ipython、pandas、requests、sentry-sdk（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/948](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/948)#948”）
• [自动] 约束升级：ipython、nme、qtconsole、requests、sentry-sdk（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/955](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/955)#955”）
• [自动] 约束升级：ipykernel、local-migrator、pyinstaller、sentry-sdk、sympy（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/957](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/957)#957”）
• [自动] 约束升级：sentry-sdk、xlsxwriter（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/959](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/959)#959”）
• [自动] 约束升级：requests（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/961](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/961)#961”）
• [自动] 约束升级：imageio、pandas、pydantic、pyopengl-accelerate、sentry-sdk、xlsxwriter（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/970](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/970)#970”）

⚙️ 其他任务

• 改进ruff配置，删除isort（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/815](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/815)#815”）
• 使用tox-gh-actions中的fail_on_no_env功能（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/842](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/842)#842”）
• 将python 3.11添加到支持的版本列表（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/867](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/867)#867”）
• 由于超时禁用python 3.11测试（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/870](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/870)#870”）
• 将ruff提升到0.0.218，从pre-commit中删除flake8（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/880](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/880)#880”）
• 用aganders3/headless-gui替换GabrielBB/xvfb-action@v1，第2部分（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/887](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/887)#887”）
• 改进最小需求测试（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/888](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/888)#888”）
• 改进正则表达式，以正确生成更新报告中包的列表（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/894](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/894)#894”）
• 添加对PR标题的检查（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/933](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/933)#933”）
• 更新codecov配置，在发布信息之前等待两个报告（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/934](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/934)#934”）
• [pre-commit.ci] pre-commit自动更新（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/945](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/945)#945”）
• 从nme迁移到local_migrator（《[https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/951](https://github.com/4DNucleome/PartSeg/pull/951)#951”）
• 【pre-commit.ci】pre-commit 自动更新 (#956)
• 【pre-commit.ci】pre-commit 自动更新 (#964)

🛡️ 安全性

• (依赖) 将 peter-evans/create-pull-request 从 4 升级到 5 (#928)

修复错误

• 修复生成具有隐藏字段的模型表单的bug (#920)

依赖项

• 【自动】依赖项升级 (#824)
• 【自动】依赖项升级 (#828)
• 【自动】依赖项升级：ipykernel，packaging (#838)
• 【自动】依赖项升级：imageio，ipykernel，napari，numpy，sentry (#850)
• 【自动】依赖项升级：imagecodecs，ipykernel，numpy，psygnal (#859)
• 【自动】依赖项升级：pydantic，pygments，xlsxwriter (#874)
• 【自动】依赖项升级：imageio，packaging，scipy，xlsxwriter (#878)
• 【自动】依赖项升级：ipykernel，requests，sentry，xlsxwriter (#884)
• 【自动】依赖项升级：h5py，imagecodecs，imageio，ipykernel，pandas，sentry，tifffile (#889)
• 【自动】依赖项升级：ipython，pyqt5 (#893)
• 【自动】依赖项升级：imageio，ipykernel，ipython，numpy，openpyxl，psygnal，pydantic，pyinstaller，pyqt5，scipy，sentry-sdk，tifffile，xlsxwriter (#897)
• 【自动】依赖项升级：imageio，psygnal (#905)
• 【自动】依赖项升级：ipython，magicgui，scipy，sentry-sdk，tifffile (#906)
• 【自动】依赖项升级：imagecodecs，imageio，ipykernel，openpyxl，pydantic，pyinstaller，qtawesome，qtconsole，sentry-sdk，tifffile，xlsxwriter (#908)
• 【自动】依赖项升级：imageio，ipykernel，ipython，pandas，psygnal，pydantic，pygments，pyinstaller，qtpy，sentry-sdk，tifffile (#917)

0.14.6 - 2022-11-13

🐛 错误修复

• 修复加载已创建的项目时导致 ROI 图层隐藏的bug (#787)

0.14.5 - 2022-11-09

🚀 功能

• 为 EventedDict 添加确保类型的选项，并使用它来验证配置文件结构 (#776)
• 在错误报告对话框中添加创建问题的选项 (#782)
• 在算法参数中添加多行字段的选项 (#766)

🐛 错误修复

• 修复刻度条颜色问题 (#774)
• 修复在掩码分析中保存分割参数时的bug (#781)
• 修复交互模式下加载新文件时的多个错误 (#784)

🚜 重构

• 优化 CLI 操作 (#772)
• 清除有关阈值方法的警告 (#783)

构建

• (依赖) 将 chanzuckerberg/napari-hub-preview-action 从 0.1.5 升级到 0.1.6 (#775)

0.14.4 - 2022-10-24

🚀 功能

• 在 napari 中打开 PartSeg 项目时加载替代标签 (#731)
• 添加切换比例尺条选项（《#733》）
• 使用环境变量PARTSEG_SETTINGS_DIR允许自定义设置目录（《#751》）
• 将最近算法与一般应用设置分开（《#752》）
• 添加多个otsu作为阈值方法，具有组件选择范围（《#710》）
• 添加从ROI分析中加载具有背景的组件的功能（《#768》）

🐛 错误修复

• 修复拼写错误
• 修复get_theme调用以准备napari 0.4.17（《#729》）
• 修复从GUI保存流程（《#756》）
• 修复配置文件导出/导入对话框（《#761》）
• 如果ROI可用，启用比较按钮（《#765》）
• 修复使用roi裁剪时产生黑色伪影的bug（《#767》）

🧪 测试

• 添加新的构建和检查轮功能（《#747》）

⚙️ 其他任务

• 为napari 0.4.17准备pyinstaller配置（《#748》）
• 添加ruff linter（《#754》）

修复错误

• 修复sentry测试（《#742》）
• 修复从驱动器加载设置时的错误报告（《#725》）

构建

• (deps) 将actions/checkout从2提升到3（《#716》）
• (deps) 将actions/download-artifact从1提升到3（《#709》）

0.14.3 - 2022-08-18

🐛 错误修复

• 如果算法仍在运行，则延迟设置图像（《#627》）
• 在可重启的分割算法中找不到组件时，错误报告不正确（《#633》）
• 修复构建文档的过程（《#653》）

🚜 重构

• 清除潜在漏洞（《#630》）

🧪 测试

• 为常见GUI元素添加更多测试（《#622》）
• 按包报告覆盖率（《#639》）
• 更新conda环境，测试时不要使用PyQt5（《#646》）
• 将测试文件添加到计算覆盖率（《#655》）

构建

• (deps) 在/requirements中将qtpy从2.0.1提升到2.1.0（《#613》）
• (deps) 在/requirements中将pyinstaller从5.0.1提升到5.1（《#629》）
• (deps) 在/requirements中将tifffile从2022.4.28提升到2022.5.4（《#619》）
• (deps) 在/requirements中将codecov/codecov-action从1提升到3（《#637》）
• (deps) 在/requirements中将requests从2.27.1提升到2.28.0（《#647》）
• (deps) 在/requirements中将actions/setup-python从3提升到4（《#648》）
• (deps) 在/requirements中将pyqt5从5.15.6提升到5.15.7（《#652》）
• (deps) 在/requirements中将sentry-sdk从1.5.12提升到1.6.0（《#659》）
• (deps) 在/requirements中将numpy从1.22.4提升到1.23.0（《#660》）
• (deps) 在/requirements中将lxml从4.9.0提升到4.9.1（《#665》）
• (依赖项) 将 mahotas 从 1.4.12 升级到 1.4.13，在 /requirements 中 (#662)
• (依赖项) 将 pyinstaller 从 5.1 升级到 5.2，在 /requirements 中 (#667)

0.14.2 - 2022-05-05

🐛 错误修复

• 修复会话间保存标签颜色的问题 (#610)
• 在启动 napari 小部件之前注册 PartSeg 插件。 (#611)
• 高亮后鼠标与组件的交互恢复正常。 (#620)

🚜 重构

• 限制测试运行 (#603)
• 在测试中过滤并解决警告 (#607)
• 在 SpinBox 中使用 QAbstractSpinBox.AdaptiveDecimalStepType 而不是硬编码的范围 (#616)
• 清理和测试 PartSeg.common_gui.universal_gui_part (#617)

📚 文档

• 更新更改日志 (#621)

🧪 测试

• 通过为 pip 设置缓存加快测试速度 (#604)
• 为 azure pipelines 工作流程设置缓存 (#606)

构建

• (依赖项) 将 sentry-sdk 从 1.5.10 升级到 1.5.11，在 /requirements 中 (#615)

0.14.1 - 2022-04-27

🚀 功能

• 使用 pygments 为异常窗口中的代码着色 (#591)
• 添加计算掩码组件测量值的选项 (#590)

🐛 错误修复

• 更新构建 wheel 和 sdist 以包含适当的版本标签 (#583)
• 修复 napari 测量小部件中删除第一个测量条目的问题 (#584)
• 修复 conda Pyside2 版本的兼容性错误 (#595)
• 当加载同步并新加载的图像与当前加载的图像维度不同时发生错误。 (#598)

🚜 重构

• 重构创建批处理计划小部件并为其添加测试 (#587)
• 将 napari 版本降级到 0.4.12 以下 (#592)
• 更新 ROI 掩码算法的顺序，使其与旧版 PartSeg 版本相同 (#600)

构建

• (依赖项) 将 partsegcore-compiled-backend 从 0.13.11 升级到 0.14.0，在 /requirements 中 (#582)
• (依赖项) 将 simpleitk 从 2.1.1 升级到 2.1.1.2，在 /requirements 中 (#589)
• (依赖项) 将 pyinstaller 从 4.10 升级到 5.0，在 /requirements 中 (#586)

0.14.0 - 2022-04-14

🚀 功能

• 在 Search Label napari 插件中允许从界面设置缩放因子 (#538)
• 在主 GUI 中添加控制搜索 ROI 缩放因子的选项 (#540)
• 改进序列化机制，允许本地迁移数据结构声明 (#462)
• 使 `*.obsep" 文件在 PartSeg Analysis 中可加载 (#564)
• 从批处理计划中添加提取测量配置文件或 roi 提取配置文件的选项 (#568)
• 允许从批处理结果的 excel 文件中导入计算计划 (#567)
• 在反序列化数据失败时改进错误报告 (#574)
• 从 napari 启动 PartSeg GUI (#581)

🐛 错误修复

• 修复 PartSeg ROI 掩码中的 "显示选中" 渲染模式 (#565)

🚜 重构

• 将 PartSegImage.Image 通道存储为分离的数组（#554）
• 删除已弃用模块。（#429）
• 将序列化后端切换回 nme（#569）

📚 文档

• 更新变更日志并在 README 中添加新徽章（#580）

🧪 测试

• 添加创建 AboutDialog 的测试（#539）
• 为 python 3.10 设置测试。禁用此 python 的 class_generator 测试（#570）

修复错误

• 为 pydantic.BaseModel 基结构添加通过操作符 [] 访问，以保持向后兼容性（#579）

构建

• (依赖项) 在 /requirements 中将 sentry-sdk 从 1.5.2 升级到 1.5.3（#512）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 ipython 从 8.0.0 升级到 8.0.1（#513）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 pandas 从 1.3.5 升级到 1.4.0（#514）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 oiffile 从 2021.6.6 升级到 2022.2.2（#521）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 numpy 从 1.22.1 升级到 1.22.2（#524）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 tifffile 从 2021.11.2 升级到 2022.2.2（#523）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 qtpy 从 2.0.0 升级到 2.0.1（#522）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 sentry-sdk 从 1.5.3 升级到 1.5.4（#515）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 pyinstaller 从 4.8 升级到 4.10（#545）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 pillow 从 9.0.0 升级到 9.0.1（#549）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 sphinx 从 4.4.0 升级到 4.5.0（#561）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 tifffile 从 2022.2.9 升级到 2022.3.25（#562）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 sympy 从 1.10 升级到 1.10.1（#556）
• (依赖项) 在 /requirements 中将 sentry-sdk 从 1.5.7 升级到 1.5.8（#557）

0.13.15

错误修复

• 使用 translation 而不是 translation_grid 来移动层。（#474）
• napari 插件中的错误（#478）
• 使用 napari 从 roi 提取时缺少掩码（#479）
• 修复在 macos 机器上的分段错误（#487）
• napari 0.4.13 的修复（#506）

文档

• 创建 0.13.15 版本（#511）
• 为 napari hub 添加类别和预览页面工作流程（#489）

功能

• 在 napari 测量小部件中为掩码层分配属性（#480）

构建

• 在 /requirements 中将 qtpy 从 1.11.3 升级到 2.0.0（#498）
• 在 /requirements 中将 pydantic 从 1.8.2 升级到 1.9.0（#496）
• 在 /requirements 中将 sentry-sdk 从 1.5.1 升级到 1.5.2（#497）
• 在 /requirements 中将 sphinx 从 4.3.1 升级到 4.3.2（#500）
• 在 /requirements 中将 pyinstaller 从 4.7 升级到 4.8（#502）
• 在 /requirements 中将 pillow 从 8.4.0 升级到 9.0.0（#501）
• 在 /requirements 中将 requests 从 2.26.0 升级到 2.27.1（#495）
• 在 /requirements 中将 numpy 从 1.21.4 升级到 1.22.0（#499）
• 在 /requirements 中将 numpy 从 1.22.0 升级到 1.22.1（#509）
• 在 /requirements 中将 sphinx 从 4.3.2 升级到 4.4.0（#510）

0.13.14

错误修复

• ROI 的替代表示（#471）
• 在渲染 ROI 和掩码时，将加法更改为半透明（#472）

功能

• 添加形态学分水岭分割（#469）
• 添加双边图像滤波器（#470）

0.13.13

错误修复

• 修复发布时更改日志生成过程中的错误（#428）
• 在比较查看器中单击主页按钮时恢复 ROI（#443）
• 修复捆绑的PartSeg中测量名称前缀的问题。（#458）
• 在pyinstaller捆绑包中注册Napari小部件。（#465）
• 如果没有加载点，则隐藏“点”按钮；如果没有设置掩码，则隐藏“掩码”复选框。（#463）
• 替换标签数据，而不是添加/删除图层 - 修复混合图层（#464）

功能

• 在多Otsu ROI提取方法中，在图层注释中添加阈值信息。（#430）
• 添加选项以选择ROI的渲染方法。（#431）
• 向ProfileDict添加回调机制，实时更新ROI渲染参数。（#432）
• 将查看器底部的信息栏移动到适当位置。（#442）
• 在多个文件小部件中添加加载最近文件选项。（#444）
• 将ROI注释作为属性添加到由ROI提取小部件创建的napari标签图层。（#445）
• 向ProfileDict添加信号，删除冗余同步机制。（#449）
• 允许忽略更新21天。（#453）
• 如果没有在掩码分割中选中组件，则保存所有组件。（#456）
• 添加搜索ROI组件的模态对话框。（#459）
• 作为napari小部件添加完整测量支持。（#460）
• 添加搜索标签作为napari小部件。（#467）

重构

• 将加载/保存对话框的通用代码导出到一个地方。（#437）
• 将大多数调用QFileDialog更改为更通用的代码。（#440）

测试

• 为PartSeg.common_backend模块添加测试。（#433）

0.13.12

错误修复

• 导入先前版本的设置。（#406）
• 不进行掩码数据裁剪。（#407）
• 在批量计划中保存到子目录。（#414）
• 加载批量处理的插件。（#423）

功能

• 为相关计算添加随机化选项。（#421）
• 为图像添加Imagej TIFF编写器。（#405）
• 为napari创建掩码小部件。（#395）
• 在napari roi提取方法中显示roi提取方法的信息。（#408）
• 在批量处理窗口中添加*[0-9].tif按钮。（#412）
• 在3d视图中更好地表示标签。（#418）

重构

• 使用Font Awesome而不是自定义符号。（#424）

0.13.11

错误修复

• 在批量准备计划中添加掩码。（#383）
• 在SearchComboBox中设置适当的完成模式。（#384）
• 在加载ROI时显示错误警告。（#385）

功能

• 添加CellFromNucleusFlow“从细胞核流动”细胞分割方法。（#367）
• 在PartSeg ROI掩码中裁剪组件时，允许不掩码外部数据。（#379）
• 在GUI中添加主题选择。（#381）
• 允许从ROI提取算法返回点。（#382）
• 添加测量以通过名称获取ROI注释。（#386）
• 将PartSeg ROI提取算法作为napari插件。（#387）
• 添加Pearson、Mander's、强度、Spearman共定位测量。（#392）
• 将独立napari设置与PartSeg嵌入的napari设置分开。（#397）

性能

• 使用更快的calc bound函数。（#375）

重构

• 删除CustomApplication。（#389）

0.13.10

• 将tiff保存后端更改为ome-tiff
• 添加DistanceROIROI和ROINeighbourhoodROI测量

0.13.9

• 注释显示错误修复

0.13.8

• napari弃用修复
• 加速简单测量
• 捆绑插件初始支持

0.13.7

• 为napari添加测量小部件
• 修复管道使用中的错误

0.13.6

• 热修复发布
• 为新napari版本做准备

0.13.5

• 错误报告的小修复
• 修复掩码分割

0.13.4

• 修复过时配置文件/管道预览的错误

0.13.3

• 修复在多个文件和历史记录中保存roi_info

0.13.2

• 修复在选择标签选项卡中显示标签

0.13.1

• 添加Haralick测量
• 添加obsep文件支持

0.13.0

• 添加算法的自定义输入小部件
• 切换到napari Colormaps而不是自定义的
• 添加点可视化
• 为内置（视图菜单）napari查看器添加同步小部件
• 停止使用Python 3.6

0.12.7

• napari 0.4.6的修复

0.12.6

• 修复prev_mask_get
• 修复掩码更改时的缓存机制
• 更新PyInstaller构建

0.12.5

• 修复管道执行中的错误

0.12.4

• 修复与ROI Mask窗口相关的构建（信号未正确连接）

0.12.3

• 修复ROI Mask

0.12.2

• 修复Windows捆绑包

0.12.1

• 最近打开文件的记录
• 添加ROI标注和ROI替代选项
• 小故障修复

0.12.0

• 在视图菜单中切换多个文件小部件
• 在视图菜单中的ROI分析中切换左侧面板
• 将蒙版分割重命名为ROI蒙版
• 添加接口文档
• 添加批量处理教程
• 将错误信息添加到批量处理输出文件中
• 从批量准备窗口加载图像
• 在部分列表和组合框中添加搜索选项
• 将拖放机制添加到加载批量窗口中的文件列表

0.11.5

• 添加查看器中的侧视图
• 修复测量结果表的横向视图

0.11.4

• 在捆绑中升级到napari 0.3.8
• 修复从项目中加载未显示的分割的故障
• 基于分割从基本一个添加图像分类的帧（1像素）
• 将Qt版本锁定到5.14

0.11.3

• 为napari 0.3.7做准备
• 将napari io插件拆分为多个部分
• 通过sentry改进对numpy数组的报告
• 修复为蒙版标记设置颜色

0.11.2

• 使用异步调用加快查看器中的图像集速度
• 修复具有参数的表的名称过长的问题

0.11.1

• 在视图菜单中添加截图选项
• 添加体素测量

0.11.0

• 缩短 sprawl 算法名称
• 统一测量名称的大写形式
• 将简单测量添加到蒙版分割
• 使用napari作为查看器
• 在视图菜单中添加预览算法附加输出的可能性
• 更新可用的算法和测量名称，使其更具描述性。

0.10.8

• 修复分割分析中查看器之间的同步问题
• 修复在批量运行期间出错时的批量崩溃，添加有关计算失败文件的详细信息
• 在“帮助”>“关于”中添加更改日志预览

0.10.7

• 在测量中，如果空列表表示组件，则平均值将返回0

0.10.6

• 修复边界边缘预览
• 修复图像预览大小问题
• 如果没有标记矩形缩放，则使用滚动和移动进行缩放

0.10.5

• 使PartSeg PEP517兼容。
• 修复Windows上的多个文件小部件（路径归一化）

0.10.4

• 修复缓慢的缩放

0.10.3

• 批量处理中元素的确定性顺序。

0.10.2

• 故障修复

0.10.1

• 故障修复

0.10.0

• 添加创建自定义标签着色。
• 将执行解释器更改为python 3.7。
• 在分割蒙版中添加遮罩操作
• 将许可证更改为BSD。
• 在批量处理中允许选择根类型。
• 在预览中添加中值滤波器

0.9.7

• 修复比较蒙版中的故障

0.9.6

• 修复加载带有蒙版的项目的故障
• 升级PyInstaller版本（GHSA-7fcj-pq9j-wh2r）

0.9.5

• 修复“分割分析”中加载项目的故障

0.9.4

• 读取蒙版分割项目
• 在批量中选择源类型
• 添加对OIF和CZI文件格式的初始支持
• 将实用工具提取到PartSegCore模块
• 添加示例笔记本的自动化测试
• 反转蒙版
• 在蒙版分割中加载分割参数
• 允许在分割工具中使用sprawl
• 为测量添加蒙版的径向分割
• 在批量中按组件表添加所有测量结果

0.9.3

• 开始自动化构建文档
• 更改颜色映射后端并允许用户创建自定义颜色映射。
• 分割比较
• 更新测试引擎
• 支持PySide2

0.9.2.3

• 重构代码以更容易创建蒙版分割的插件
• 创建基于类的更新器以更新过时的算法描述
• 修复保存功能
• 修复不同的故障

0.9.2.2

• 将静态数据提取到单独的包中
• 更新固定范围标记并添加通道控制中的高斯标记

0.9.2.1

• 添加VoteSmooth并添加平滑算法的选择

0.9.2

• 添加pypi基本检查以更新

• 移除在相同图像中更改状态时重置图像状态

• 在堆叠分割中添加从分割中选择组件的选项

• 在蒙版分割中添加

  • 组件的分割参数预览
  • 在保存文件中保存分割参数
  • 批量模式的新实现。

0.9.1

• 添加多个文件小部件

• 添加计算分割对象与蒙版之间距离的功能

• 批量处理计划修复

  • 将管道添加到计划中
  • 重新设计掩码小部件

• 修改测量后端以允许计算多通道测量。

0.9

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