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napari小部件,在napari窗口中使用yapic模型进行图像分割。要使用此插件,请安装TENSORFLOW。

项目描述

napari-yapic-prediction

License PyPI Python Version tests codecov

napari窗口中执行YAPiC模型分割预测的napari小部件插件。


napari插件是用Cookiecutter以及@naparicookiecutter-napari-plugin模板生成的。

描述

此napari插件提供了一个小部件,用于上传YAPiC训练的模型,并在napari窗口中的所有现有图像上执行分割。分割结果将自动以imgename_prediction的命名结构上传到查看器中。

安装

  1. 在安装插件之前,请根据您的系统安装与您的cudacudnn库兼容的GPU或CPU版本的tensorflow。插件的一个依赖项是yapic,它目前对tensorflow版本敏感。

  2. 您可以通过pip安装napari-yapic-prediction

    pip安装napari-yapic-prediction

贡献

贡献非常欢迎。您可以使用tox运行测试,请在提交pull请求之前确保覆盖率至少保持不变。

许可证

根据《GNU GPL v3.0》许可协议分发,"napari-yapic-prediction" 是免费和开源软件

问题

如果您遇到任何问题,请提供详细描述后提交问题

项目详情


下载文件

下载适合您平台的应用程序。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源代码分发

napari-yapic-prediction-0.2.0.tar.gz (4.4 MB 查看哈希值)

上传时间 源代码

构建分发

napari_yapic_prediction-0.2.0-py3-none-any.whl (21.0 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

支持者:

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