在napari中进行交互式表面分析，以测量生物组织中的机械应力
项目描述
napari-stress
此插件为Napari中表面的分析提供工具，例如使用射线投射方法确定和细化对象的表面表示的实用程序，以及计算表面的曲率。它重新实现了用于Gross et al. (2021): STRESS，一种用于体内细胞和组织机械应力测量的变形粒子自动几何特征表征的代码，并在此存储库中开源。
用法
有关如何从napari-viewer或从代码交互式使用napari-stress的文档，请访问文档
安装
使用以下命令创建一个新的conda环境。如果您以前从未使用过conda，请先阅读此指南。
conda create -n napari-stress Python=3.9 napari jupyterlab -c conda-forge
conda activate napari-stress
然后您可以使用pip安装napari-stress
pip install napari-stress
问题
要报告错误、请求新功能或取得联系，请打开一个问题或在image.sc上标记@EL_Pollo_Diablo。
另请参阅
还有其他具有类似/重叠功能的napari插件
贡献
欢迎贡献。可以使用pytest运行测试，请在提交拉取请求之前确保覆盖率至少保持不变。
许可证
根据BSD-3许可证分发，"napari-stress"是免费和开源软件
致谢
该项目得到了德国研究共同体的支持，属于德国卓越战略——EXC2068 - 慕尼黑工业大学“生命物理学”卓越集群。
下载文件
下载您平台的文件。如果您不确定选择哪个，请了解有关安装包的更多信息。
源代码发行版
napari_stress-0.3.8.tar.gz (817.6 kB 查看哈希值)
构建版本
napari_stress-0.3.8-py3-none-any.whl (839.3 kB 查看哈希值)
关闭
napari_stress-0.3.8.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 698454e97a2cba589e00243d8a26f37d7be532cdfcf9acf091f116992160cc21 |
|
| MD5 | 13b45b0f4146f67aa34935290e3d6320 |
|
| BLAKE2b-256 | 8335df37243abd5c89b6e1655a526e5b3d8b83dfcb2bb0e17a73412a35774855 |
关闭
napari_stress-0.3.8-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 1af18fe0fe03e72aecf9010b3d13107dae8cd75ac772e9807fcedb0c5284a352 |
|
| MD5 | 98cc4eb387ba7730c0e6381613747d4a |
|
| BLAKE2b-256 | 4b542d6d40b91678afb926ad5bbc67e459fe95bfe3355e8040f6b1b6c8eaec0f |
