napari-segment-anything

Napari 插件 Segment Anything Model (SAM)

在此处下载网络权重 here

https://user-images.githubusercontent.com/21022743/230456433-2fa7bc40-a735-4d73-8d87-ecf776bbe2be.mp4

此 napari 插件是用 Cookiecutter 和 @napari 的 cookiecutter-napari-plugin 模板生成的。

安装

您可以通过 pip 安装 napari-segment-anything

pip install napari-segment-anything

我们建议安装最新开发版本，因为此包正在开发中

pip install git+https://github.com/jookuma/napari-segment-anything.git

重要：如果未安装 pyqt5 或 pyside2，则 napari 将无法工作。

说明

打开 napari-segment-anything

此软件是 napari 插件，因此一旦安装了 napari，您就可以使用命令行打开它

napari <your image path> -w napari-segment-anything 'Segment Anything'

我注意到有时 napari 无法从命令行加载插件小部件，请从下面的步骤 2 开始加载。

如果您更喜欢用户界面，则需要

1. 将您的图像拖放到 napari 中以加载它；
2. 转到右上角的“插件”文件菜单，并选择“Segment Anything”插件。
3. 按照以下说明进行使用。

重要：如果出现错误，请确保已安装 pyqt5 或 pyside2。

使用方法

• 交互操作在“SAM点”和“SAM框”图层上使用napari的现有功能进行。只有矩形形状会触发网络预测。
• 对于点监督，左键单击是正线索（对象），右键单击是负线索（背景）。
• 按下“确认标注”按钮（或“C”键）将当前分割掩码传播到标签图像。
• 使用napari标签图层功能删除或编辑已确认的标签。

贡献

欢迎贡献。可以使用tox运行测试，请在提交拉取请求之前确保覆盖率至少保持不变。

许可协议

在Apache软件许可证2.0的条款下分发，“napari-segment-anything”是免费和开源软件

问题

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