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在napari中沿线条绘制强度并创建地形视图

项目描述

napari-plot-profile (npp)

License PyPI Python Version tests codecov Development Status napari hub

绘制线条轮廓

napari中绘制线条的强度。

img.png

  • napari中打开一些图像。

  • 添加一个形状层。

img.png

  • 激活线条绘制工具或路径工具并绘制线条。

img.png

  • 绘制线条后,点击菜单插件 > 测量(绘制轮廓)
  • 如果您修改了线条,可能需要点击“刷新”按钮重新绘制轮廓。

img.png

要查看如何从Python程序化执行这些步骤,请查看演示笔记本

创建地形视图

通过将像素强度扭曲到高度来创建2D图像的3D视图。它可以显示为3D图像层、点云层或表面层。

napari插件是通过使用Cookiecutter@naparicookiecutter-napari-plugin模板生成的。


安装

您可以通过pip安装napari-plot-profile

pip install napari-plot-profile

贡献

欢迎贡献力量。可以使用tox运行测试,请在提交pull request之前确保覆盖率至少保持不变。

许可证

根据BSD-3许可协议分发,"napari-plot-profile"是免费和开源软件。

问题

如果您遇到任何问题,请在image.sc上创建一个帖子,并附带详细描述和标签@haesleinhuepf

项目详情


下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源分布

napari-plot-profile-0.2.2.tar.gz (12.1 kB 查看哈希)

上传时间

构建分布

napari_plot_profile-0.2.2-py3-none-any.whl (11.8 kB 查看哈希)

上传时间 Python 3

支持者

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