在napari中沿线条绘制强度并创建地形视图
项目描述
napari-plot-profile (npp)
绘制线条轮廓
在napari中绘制线条的强度。
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在napari中打开一些图像。
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添加一个形状层。
- 激活线条绘制工具或路径工具并绘制线条。
- 绘制线条后,点击菜单插件 > 测量(绘制轮廓)
- 如果您修改了线条,可能需要点击“刷新”按钮重新绘制轮廓。
要查看如何从Python程序化执行这些步骤,请查看演示笔记本
创建地形视图
通过将像素强度扭曲到高度来创建2D图像的3D视图。它可以显示为3D图像层、点云层或表面层。
此napari插件是通过使用Cookiecutter和@napari的cookiecutter-napari-plugin模板生成的。
安装
您可以通过pip安装napari-plot-profile
pip install napari-plot-profile
贡献
欢迎贡献力量。可以使用tox运行测试,请在提交pull request之前确保覆盖率至少保持不变。
许可证
根据BSD-3许可协议分发,"napari-plot-profile"是免费和开源软件。
问题
如果您遇到任何问题,请在image.sc上创建一个帖子,并附带详细描述和标签@haesleinhuepf。