zarr支持的OME-NGFF图像的阅读器。
项目描述
napari-ome-zarr
zarr支持的OME-NGFF图像的阅读器。
此napari插件是用Cookiecutter和@napari的cookiecutter-napari-plugin模板生成的。
安装
如果尚未安装，请安装napari。
您可以通过pip安装napari-ome-zarr。激活与您安装napari相同的环境，然后
pip install napari-ome-zarr
用法
Napari将使用napari-ome-zarr插件打开插件识别为ome-zarr的图像。将使用来自OMERO的图像元数据在napari中设置通道名称和渲染设置：
napari "https://uk1s3.embassy.ebi.ac.uk/idr/zarr/v0.3/9836842.zarr/"
如果Napari弹出一个对话框，建议您选择阅读器，请选择napari-ome-zarr并单击“确定”。您可以通过添加以下示例中的--plugin napari-ome-zarr来停止这种情况发生。
打开本地文件：
napari --plugin napari-ome-zarr 13457227.zarr
或者，在Python中：
import napari
viewer = napari.Viewer()
viewer.open("https://uk1s3.embassy.ebi.ac.uk/idr/zarr/v0.4/idr0101A/13457537.zarr", plugin="napari-ome-zarr")
napari.run()
贡献
非常欢迎贡献。可以使用tox运行测试，请在提交拉取请求之前确保覆盖率至少保持不变。
许可证
遵循BSD-3许可证的条款，“napari-ome-zarr”是免费和开源软件。
问题
如果您遇到任何问题，请附上详细描述后提交问题。
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napari_ome_zarr-0.6.1.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 3d3054823c2adaa4d2bf370c46adcc4a54192cfec3bbbe98d144e50b95bd6f89 |
|
| MD5 | 8e60d2a17dc60829c164e615c1b5d0c4 |
|
| BLAKE2b-256 | 6750630bff98a60e71fad6a1e9a5cee3df7a043c88668ff752dacedbf0d987d1 |
关闭
napari_ome_zarr-0.6.1-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 5b8ff2ef448c179a63261e240b8a1dcc92f79afe67aea4d9ecd14f8bccff7585 |
|
| MD5 | 116101d544aee1c73c9e32fb32a70029 |
|
| BLAKE2b-256 | 0d818088d4d695ff7b93af4b1224448ec3270990c37d4e77bdb454c0078384e7 |
