napari-micromanager

由pymmcore-plus和pymmcore-widgets提供的napari与micromanager之间的GUI界面

安装

您可以通过pip安装napari-micromanager

pip install napari-micromanager

您还需要一个Qt后端，例如PySide2/6或PyQt5/6。 建议使用PyQt，因为它经过更多测试。如果您之前已使用pip install napari[all]将napari安装到该环境中，那么您可能已经安装了它。如果没有，您还需要安装一个您选择的Qt后端。

pip install pyqt5  # or any of {pyqt5, pyqt6, pyside2, pyside6}

获取micromanager适配器

获取micromanager适配器最简单的方法是使用

mmcore install

这将把micromanager安装到您的site-package目录下的pymmcore_plus文件夹中；使用这个来查看位置

python -c "from pymmcore_plus import find_micromanager; print(find_micromanager())"

或者，您可以使用MICROMANAGER_PATH环境变量将pymmcore_plus指向您自己的micromanager安装

export MICROMANAGER_PATH='/path/to/Micro-Manager-...'

贡献

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使用插件启动napari

您可以使用launch-dev.py脚本来启动napari并自动加载此插件

python launch-dev.py

或者您可以运行

napari -w napari-micromanager

许可证

在BSD-3许可条款下分发，“napari-micromanager”是免费的开源软件

问题

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