napari-live-flim

实时FLIM分析插件

此 napari 插件是用 Cookiecutter 通过 @napari 的 cookiecutter-napari-plugin 模板生成的。

必需依赖项

• OpenScan TCSPC模块及其所有依赖项。
  • 验证FLIM电子设备与OpenScan兼容
• Python和napari软件包及其所有依赖项

您可以通过pip安装napari

pip install napari[all]

安装

您可以通过pip安装napari-live-flim

pip install napari-live-flim

用法

1. 在MicroManager中，在名为OpenScanFLIM-BH-TCSPC-SendFLIMHistogramsToUDPPort的设备属性设置中设置端口号
2. 在Napari中，选择“插件 > FLIM查看器（napari-live-flim）”以运行插件。输入相同的端口号以连接到OpenScan。
3. 在MicroManager中开始采集。
4. 在napari中实时交互FLIM数据。
   • 根据需要修改FLIM参数和显示过滤器设置。
   • 通过点击相关“新选择”按钮，将选择添加到寿命图像或相量图。
   • 使用鼠标光标操纵选择，并使用图层控件修改选择图层。
   • 在采集过程中单击快照按钮以获取快照。
   • 使用寿命图像下方的滚动条调用特定快照。
5. 在MicroManager内停止扫描以结束采集。

贡献

欢迎贡献。可以使用tox运行测试，请在提交pull request之前确保覆盖率至少保持不变。

许可证

根据GNU GPL v3.0许可协议分发，“napari-live-flim”是免费和开源软件。

问题

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