napari-hdf5-labels-io

napari插件，用于将napari项目存储在.h5文件中。标签层以稀疏表示形式（COO列表）存储。

此napari插件是用Cookiecutter和@napari的cookiecutter-napari-plugin模板生成的。

描述

此napari插件提供了一种写入器和读取器，用于将当前napari窗口中的现有层存储为HDF5文件。所有元数据也都存储在此文件中。当打开项目文件时，包括所有存储的首选项。

标签层使用Sparse模块以坐标列表的稀疏表示形式存储，以尽可能保持项目文件大小最小（计划在未来的其他层中实现此功能）。

HDF5文件架构

项目文件是由h5py模块生成的HDF5文件。文件组对应于不同的napari层类型，层元数据存储为每个层的属性。

在元字典嵌套在LayerData元字典（napari IO）中的情况下，在外部字典中生成新键以用作h5数据集属性。读者重建此嵌套字典架构以确保格式兼容性。

安装

您可以通过pip安装napari-hdf5-labels-io。

pip install napari-hdf5-labels-io

贡献

欢迎贡献。可以使用 tox 运行测试，请在提交 pull request 之前确保覆盖率至少保持不变。

许可证

根据 GNU GPL v3.0 许可证分发，“napari-hdf5-labels-io” 是免费和开源软件。

问题

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