Python中的n维数组查看器
项目描述
napari
Python的多维图像查看器
napari 是一个快速、交互式的Python多维图像查看器。它专为浏览、注释和分析大型多维图像而设计。它基于Qt（用于GUI）、vispy（用于基于GPU的高性能渲染）和科学Python堆栈（numpy、scipy）构建。
我们在公开开发 napari！但项目处于 alpha 阶段，每个版本都可能进行 破坏性更改。您可以通过此存储库跟踪进度，在我们发布新版本时测试它们，并提供想法和代码。
如果您想参考我们的文档，请访问napari.org。如果您想为其做出贡献，请参阅下面的 贡献 部分。
我们正在开发教程，但您也可以通过以下内容快速入门。
安装
建议将 napari 安装到虚拟环境中，例如
conda create -y -n napari-env -c conda-forge python=3.9
conda activate napari-env
python -m pip install "napari[all]"
如果您更喜欢 conda 而不是 pip，可以将最后一行替换为： conda install -c conda-forge napari pyqt
有关完整的安装指南，请参阅此处。
简单示例
（以下示例需要 scikit-image 包才能运行。我们仅使用此包的数据样本进行演示。如果您将示例更改为使用自己的数据集，您可能不需要安装此包。）
在 IPython 壳内部，您可以通过调用以下命令打开交互式查看器
from skimage import data
import napari
viewer = napari.view_image(data.cells3d(), channel_axis=1, ndisplay=3)
要从脚本中使用 napari，请使用 napari.run()
from skimage import data
import napari
viewer = napari.view_image(data.cells3d(), channel_axis=1, ndisplay=3)
napari.run() # start the "event loop" and show the viewer
功能
请查看我们的examples 文件夹中的脚本，以了解我们正在开发的某些功能！
napari 支持 six 种主要不同的图层类型，即 Image、Labels、Points、Vectors、Shapes 和 Surface，每种类型对应不同的数据类型、可视化和交互性。您可以将不同类型的多个图层添加到查看器中，然后开始使用它们，调整它们的属性。
我们所有的图层类型都支持 n 维数据，查看器还提供了快速浏览和可视化数据 2D 或 3D 切片的能力。
napari 还支持查看器和 Python 内核之间的双向通信，这在从 jupyter 笔记本启动或使用我们内置的控制台时特别有用。使用控制台允许您与查看器交互式地加载和保存数据，并通过程序方式控制查看器的所有功能。
您可以通过自定义快捷键、键绑定和鼠标功能来扩展 napari。
教程
有关如何使用 napari 的更多详细信息，请查看我们的 教程。这些教程仍在不断完善中，但我们会定期更新。
使命、价值观和路线图
有关我们对 napari 的计划，您可以阅读我们的 使命和价值观声明，其中包含关于我们支持 napari 插件生态系统的愿景的更多详细信息。您可以在项目路线图中查看详细信息。
贡献
欢迎贡献！请阅读我们的 贡献指南 以开始。由于我们处于早期阶段，您可能希望在加入之前先在 GitHub Issues 上联系。
如果您想对我们的文档进行贡献或编辑，请访问 napari/docs。
行为准则
napari 有一个 行为准则，所有参与 napari 社区的人都应遵守。
治理
您可以通过我们的 治理模式 了解更多关于 napari 项目的组织和管理的相关信息，其中包括有关 @napari/steering-council 和 @napari/core-devs 的信息以及联系方式。
引用 napari
如果您觉得 napari 有用，请使用以下 DOI 引用 此存储库
napari 贡献者（2019）。napari：一个用于 Python 的多维图像查看器。 doi:10.5281/zenodo.3555620
注意，此 DOI 将解析到 napari 的所有版本。要引用特定版本，请在我们zenodo 页面上找到该版本的 DOI。最新版本的 DOI 在此页面的顶部徽章中。
帮助
我们是 image.sc 论坛 的社区合作伙伴，所有帮助和支持请求都应使用 napari 标签发布在论坛上。我们期待在那里与您互动。
错误报告应在我们的 GitHub issues 上使用错误报告模板进行。如果您认为某些功能不起作用，请不要犹豫，联系我们 - 很可能是我们而不是您的问题！
机构和资金合作伙伴
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个，请了解有关安装包的更多信息。
源代码分发
构建分发
napari-0.5.4.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 3311140a873c903b7975d1607dadab04c3f94dbb3f9c3c599bb31c5c981591e4 |
|
| MD5 | 62d82b7a4c11987aa049fcc9bfd248af |
|
| BLAKE2b-256 | 7afcd2a0525499582a3367d963ddf58b516e86b934e18784011e340fe2a36012 |
napari-0.5.4-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | aa732ea7bcd3698442db1295c75f11a3a5e0930fa0efdfb628250d7125d9e88e |
|
| MD5 | aaba2b4a8208841db3d4397e1b53c58f |
|
| BLAKE2b-256 | 7ec86bcaf27758397c8f1da906113bc99a9a4bbbc062835c2bff4fb2c3406753 |
