morphometrics

用于从图像中量化形状和邻域的插件。

此napari插件是用Cookiecutter通过@napari的cookiecutter-napari-plugin模板生成的。

安装

conda环境文件

您可以通过我们的conda环境文件安装morphometrics。为此，首先在您的计算机上安装anaconda或miniconda。然后，下载environment.yml文件（右键单击链接并“另存为...”）。在您的终端中，导航到下载environment.yml文件的目录

cd <path/to/downloaded/environment.yml>

然后使用以下命令创建morphometrics环境

conda env create -f environment.yml

环境创建完成后，您可以激活它，并按以下说明使用morphometrics。

conda activate morphometrics

如果您使用Mac OS或Linux，请安装以下内容

Mac

conda install -c conda-forge ocl_icd_wrapper_apple

Linux

conda install -c conda-forge ocl-icd-system

开发安装

要安装最新开发版本

pip install git+https://github.com/kevinyamauchi/morphometrics.git

示例应用

贡献

欢迎贡献。可以使用 tox 运行测试，请在提交拉取请求之前确保覆盖率至少保持不变。

许可证

在 BSD-3 许可证下分发，“形态计量学”是免费和开源软件。

问题

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