MOF分解器 0.0.6

💪 入门指南

mof = MOF.from_cif('tests/test_files/HKUST-1.cif')

分解MOF

fragments = mof.fragment()

如果您在Jupyter笔记本中，可以可视化组件。

fragments.linkers[0].show_molecule()

fragments.nodes[0].show_molecule()

您还可以在PubChem中搜索构建块

fragments.linkers[0].search_pubchem()

要获取RCSR代码，请运行

fragments.net_embedding.rcsr_code

🚀 安装

要安装最新版本，请运行

pip install moffragmentor

要安装开发版本，请运行

pip install git+https://github.com/kjappelbaum/moffragmentor.git

您需要安装openbabel，您可以使用conda install -c conda-forge openbabel进行安装。

作为工具，您还可以运行bash create_conda.sh以创建包含所有依赖项的conda环境。注意，您可能需要更改环境名称（默认为moffragmentor）。

MOF分解器在MOF分解工具景观中的位置

尽管moffragmentor具有一些独特功能，但它可能不是完成您任务的正确工具。由于一些设计选择（具有所有片段和网络的pymatgen表示），在当前实现中它相对较慢（尽管有明显的修复方法）。

因此，我们鼓励您也考虑其他替代工具

• mofid
• mBUD

👐 贡献

贡献，无论是提交问题、提交拉取请求还是分支，都受到欢迎。有关参与的信息，请参阅CONTRIBUTING.rst。

⚖️ 许可证

本包中的代码采用MIT许可证。

💰 资助

本研究得到欧洲研究委员会（ERC）的支持，该委员会隶属于欧盟的“地平线2020”研究和创新计划（协议号666983，MaGic），由NCCR-MARVEL资助，由瑞士国家科学基金会（SNSF）资助，并得到瑞士国家科学基金会（SNSF）的资助，协议号为200021_172759。