大分子结构 (.pdb/.mmCIF) 作为 pandas 数据帧
项目描述
大分子数据帧 (mmdf)
MacroMolecular DataFrames (mmdf) 是一个用于将大分子结构文件 (.pdb/.mmCIF) 读取到 pandas 数据帧中的小型包。
读取结构文件的重任由 gemmi 承担。
用法
import mmdf
df = mmdf.read('4v6x.cif')
df.head()
Out[3]:
model chain residue residue_id ... z charge occupancy b_isotropic
0 1 Az ASN 3 ... -54.829 0 1.0 10.0
1 1 Az ASN 3 ... -54.691 0 1.0 10.0
2 1 Az ASN 3 ... -53.642 0 1.0 10.0
3 1 Az ASN 3 ... -53.007 0 1.0 10.0
4 1 Az ASN 3 ... -54.239 0 1.0 10.0
[5 rows x 13 columns]
下载文件
下载适合您平台文件。如果您不确定要选择哪个，请了解更多关于 安装软件包 的信息。
源分布
mmdf-0.0.2.tar.gz (5.7 MB 查看哈希)
构建版本
mmdf-0.0.2-py3-none-any.whl (4.1 kB 查看哈希值)
关闭
mmdf-0.0.2.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 3c21b04082c5f930173e1d05b302d95c91cf27c65d331c1f67c594e6e6c1004a |
|
| MD5 | 0cc97a275558062ff462d8f5d6da2b39 |
|
| BLAKE2b-256 | 0d9dc5679d49ad86e0405a0df00cb2fd3e6a619059435509c4ca81bff0ba0fee |
关闭
mmdf-0.0.2-py3-none-any.whl 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | c446ad57414e767d3a4ef930e2b690d00e4c23c724329060a921483546ce967b |
|
| MD5 | bdc13da1490e242cabaa2835d8246eab |
|
| BLAKE2b-256 | 929f66200115e783a5ebab2f50e7ef817aa1203db6e529ca12fa0c9c41533d8b |