gnuhealth-fhir-server 0.9b7

历史

2014年3月，我开始为 Python 开发了 FHIR 的初始 alpha 项目，目的是用于 GNUHealth HMIS（服务器和客户端）和其他 EMRs。(https://pypi.ac.cn/project/fhir)

不久之后，我们的同事Chris Zimmerman博士加入了该项目，并出色地持续并领导了GNUHealth FHIR服务器多年的开发工作。

多年来，FHIR开发一直是GNU Health HMIS“后端”的一部分。虽然一开始方便，但我们觉得GNU Health FHIR组件应该有自己的仓库。2020年，我们在GNU Savannah创建了health-fhir-server mercurial仓库。这使得可以有一个专门负责FHIR资源的团队。

2020年，我们在Pypi上创建了GNU Health FHIR服务器包（https://pypi.ac.cn/project/gnuhealth-fhir-server）

GNU Health FHIR服务器仍在开发中。我们很高兴与HL7 FHIR社区合作，添加新的资源和功能。

与其他GNU Health组件一样，其开发在GNU Savannah。

安装

GNU Health FHIR服务器可以通过pip安装

服务器需要Flask及其一些插件。当然，还需要一个正常工作的GNU Health HMIS实例。

$ pip3 install –upgrade –user gnuhealth-fhir-server

配置

服务器附带一个简单的生产配置文件（server/config.py）。但是，需要对其进行编辑。

TRYTON_DATABASE = ''    # GNU Health database
SERVER_NAME = ''        # Domain name of the server (e.g., fhir.example.com)
SECRET_KEY = ''         # Set this value to a long and random string

安全

使用TLS。敏感的医学信息必须受到保护和保密。

默认情况下，所有FHIR端点（除了Conformance声明）都需要用户身份验证。用户身份验证和访问遵循Tryton的模式，尊重模型和字段访问权限。

用于登录GNU Health的相同凭据也用于访问FHIR REST服务器。

运行服务器

对于开发，只需运行

python ./gnuhealth_fhir_server.py

对于生产环境，您应该从WSGI容器运行它，例如gunicorn、uWSGI或Tornado。

• uwsgi server_uwsgi.ini

您可以在server_uwsgi.ini中更改端口号（默认8020）和套接字。

当前资源/端点

目前实现了以下资源（只读）

FHIR标准定义了一个REST API，一组与每个资源的交互。每个资源处理不同类型的信息。目前，GNU Health FHIR服务器支持12个资源

• Conformance：描述服务器的FHIR功能。

• Patient：患者信息，如电子邮件、地址、SSN等。

• DiagnosticReport：完成的实验室测试，但不包括数据

• Observation：实验室数据，如尿酸值

• Practitioner：卫生专业人员及其信息

• Procedure：手术/操作

• Condition：疾病/诊断

• FamilyHistory：患者的家族史

• Medication：药物（不是处方！）

• MedicationStatement：患者服用的药物

• Immunization：疫苗接种

• Organization：机构、部门、公司等。

每个资源都有自己的端点。例如，Patient端点位于/Patient，DiagnosticReport端点位于/DiagnosticReport，依此类推。唯一例外的是Conformance端点，位于/和/metadata。

查询GNU Health FHIR服务器

如果我们以资源名称作为端点，GNU Health将返回所有结果。

例如： https://federation.gnuhealth.org:8700/Patient

将检索当前数据库中的患者。

要搜索资源，只需向端点添加参数以细化搜索。例如，/Patient?name=ana将返回所有名字中包含Ana的患者

日志文件将存储在用户的家目录中，文件名为“fhir_server.log”。您也可以在运行uwsgi后的服务器中添加相应的日志。

技术

GNU Health HMIS FHIR服务器基于Flask技术（https://flask.org.cn/）构建。

有关Flask及其在GNU Health FHIR服务器中使用的插件更多信息

• Flask

• Flask-Login

• Flask-Tryton

• Flask-Restful

• Flask-WTF

开发

GNU Health 项目的开发位于 GNU Savannah，使用 Mercurial 仓库。

任务、错误和邮件列表将在 health-dev@gnu.org 上，用于开发。

一般讨论在 health@gnu.org 邮件列表中进行。

主页

https://www.gnuhealth.org

文档

GNU Health FHIR 服务器文档将在 GNU Health Wikibook 的相应章节中

https://wikibooks.cn/wiki/GNU_Health

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Dr. Luis Falcón, MD, MSc
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许可

GNU Health，自由数字健康生态系统，采用 GPL v3+ 许可

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