ephyviewer是为电生理信号、事件、视频等提供简单查看器的Python库
项目描述
ephyviewer是为电生理信号、事件、视频等提供简单查看器的Python库
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ephyviewer是一个基于pyqtgraph的Python库，用于构建电生理信号、视频、事件、epochs、spike trains、数据表和信号的时间-频率表示的定制查看器。它还提供epoch编码器以创建注释。
ephyviewer可以在两个级别上使用：独立应用程序和库。
有关利用ephyviewer作为库的功能的示例应用程序，请参阅neurotic应用程序和这篇论文
Gill, J. P., Garcia, S., Ting, L. H., Wu, M., & Chiel, H. J. (2020). neurotic: Neuroscience Tool for Interactive Characterization. eNeuro, 7(3). https://doi.org/10.1523/ENEURO.0085-20.2020
独立应用程序
独立应用程序支持Neo的RawIO接口（Axograph、Axon、Blackrock、BrainVision、Neuralynx、NeuroExplorer、Plexon、Spike2、Tdt等；有关完整列表，请参阅neo.rawio文档）所支持的文件类型。
从控制台启动它，并使用菜单选择数据文件
ephyviewer
或者，从控制台使用文件名（可选格式）启动它
ephyviewer File_axon_1.abf ephyviewer File_axon_1.abf -f Axon
用于为电生理数据集设计自定义查看器的库
使用如下代码构建查看器
import ephyviewer
import numpy as np
app = ephyviewer.mkQApp()
#signals
sigs = np.random.rand(100000,16)
sample_rate = 1000.
t_start = 0.
view1 = ephyviewer.TraceViewer.from_numpy(sigs, sample_rate, t_start, 'Signals')
win = ephyviewer.MainViewer(debug=True, show_auto_scale=True)
win.add_view(view1)
win.show()
app.exec()查阅文档获取更多示例。
下载文件
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源分发
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构建分发
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