为Clinica设计的FSL Pydra任务
项目描述
pydra-fsl
为Clinica设计的FSL Pydra任务。
Pydra是一个数据流引擎，它提供了一组用于DAG构建、操作和分布式执行的轻量级抽象。
FSL是用于FMRI、MRI和DTI脑成像数据的综合分析工具库。
可用任务
| 模块 | 任务 |
|---|---|
| bet | BET, RobustFOV |
| eddy | Eddy, ApplyTopup, Topup |
| fast | FAST |
| flirt | FLIRT, ApplyXFM, ConcatXFM, ConvertXFM, InvertXFM, FixScaleSkew, Img2ImgCoord, Img2StdCoord, Std2ImgCoord |
| fnirt | FNIRT, FNIRTFileUtils, ApplyWarp, ConvertWarp, InvWarp |
| fugue | FUGUE, PrepareFieldmap, Prelude, SigLoss |
| maths | (实验性) Maths, Mul |
| susan | SUSAN |
| utils | ChFileType, FFT, Info, Interleave, Merge, Orient, Reorient2Std, ROI, SelectVols, Slice, SmoothFill, Split, SwapDim |
安装
pip install clinica-pydra-fsl
使用此包需要单独安装FSL。请参阅FSL的安装说明和许可详情。
开发
本项目使用Hatch进行管理。
pipx install hatch
运行测试套件
hatch run test
修复linting问题
hatch fmt
许可证
本项目根据Apache License, Version 2.0条款进行分发。
下载文件
下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个，请了解更多关于安装包的信息。
源代码发行版
clinica_pydra_fsl-0.1.0.tar.gz (29.6 kB 查看哈希)
构建发行版
clinica_pydra_fsl-0.1.0-py3-none-any.whl (48.5 kB 查看哈希)
关闭
clinica_pydra_fsl-0.1.0.tar.gz 的哈希
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 6e371734c829fb01e072d646be4facd7c7f80f5ea48f661c83df6897d9f72008 |
|
| MD5 | b17836c151db726a675e6cc311922028 |
|
| BLAKE2b-256 | a3d29ef32ad4864b396016ebebb994b130eb22dbecc78767924f18cc79bb3b13 |
关闭
clinica_pydra_fsl-0.1.0-py3-none-any.whl 的哈希
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 67f34818bc286558b6c871b9963c43ebeea1cd3495c3717d3a6cc534350fc974 |
|
| MD5 | 5cdbced25e1fcf2960626ef45b5565ff |
|
| BLAKE2b-256 | 6c646c731e19cd0617e897bade732be3cdaa470cbd6eb3769342a60b15bd6ba5 |
