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用于处理高通量淋巴细胞受体测序数据的生物信息学工具包。

项目描述

https://img.shields.io/pypi/dm/changeo https://img.shields.io/static/v1?label=AIRR-C%20sw-tools%20v1&message=compliant&color=008AFF&labelColor=000000&style=plastic

Change-O - 克隆群分配工具包

Change-O 是一套用于处理 V(D)J 定位工具输出的工具,将克隆群分配到免疫球蛋白 (Ig) 序列,并重建基因序列。

高通量测序技术的显著进步现在使得对 Ig 库的大规模表征成为可能,Ig 库定义为位于 B 细胞和 T 细胞表面的跨膜抗原受体蛋白的集合。Change-O 是一套实用工具,用于在基因片段分配后进行 Ig 和 TCR 序列的高级分析。Change-O 处理 IMGT/HighV-QUEST 和 IgBLAST 的输出,并提供各种聚类方法将克隆群分配到 Ig 序列。还包括记录排序、分组和各种数据库操作。

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