CellRank:多视角单细胞数据的动力学
项目描述
CellRank 2:多视角单细胞数据统一命运图谱
CellRank 是一个模块化框架,用于基于多视角单细胞数据的马尔可夫状态模型研究细胞动力学。请参阅我们的文档,以及CellRank 1和CellRank 2 论文以了解更多信息。有关如何正确引用我们的工作的说明,请参阅此处。
CellRank 可扩展到大量细胞,与scverse生态系统完全兼容,易于使用。在后台,它由pyGPCCA(Reuter et al. (2018))提供支持。如果您遇到错误,需要我们的帮助或只想发表评论/建议,请随时提交问题或发送电子邮件。
CellRank 的关键应用
基于各种生物先验估计分化方向,包括RNA速度(La Manno et al. (2018),Bergen et al. (2020))、任何伪时间或发育潜力、实验时间点、代谢标签等。
计算初始、终端和中间宏观状态。
推断命运概率和驱动基因。
可视化并聚类基因表达趋势。
... 更多功能,请参阅我们的文档。
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算法 | 哈希摘要 | |
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cellrank-2.0.6-py3-none-any.whl的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | 165d618e9588e1c5b92efc3648d4cb6e3d5b769771f00b68dd175841a466023b |
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