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注释数据。

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anndata - 注释数据

anndata 是一个用于在内存和磁盘上处理注释数据矩阵的 Python 包,位于 pandas 和 xarray 之间。anndata 提供了包括稀疏数据支持、延迟操作和 PyTorch 接口在内的一系列计算效率高的功能。

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  • scverse Discourse 上提问。
  • 通过 pip install anndataconda install anndata -c conda-forge 安装。
  • 有关单细胞数据使用的说明,请参阅 Scanpy 的文档。anndata 最初是为 Scanpy 构建的。

anndata 是 scverse 项目(网站治理)的一部分,并由 NumFOCUS 财务赞助。请考虑为该项目做出可抵扣税款的 捐赠,以帮助项目支付开发者时间、专业服务、差旅、研讨会和各种其他需求。

引用

如果您在工作中使用了 anndata,请按照以下方式引用 anndata 预打印

anndata:注释数据

Isaac Virshup,Sergei Rybakov,Fabian J. Theis,Philipp Angerer,F. Alexander Wolf

bioRxiv 2021 年 12 月 19 日。doi:10.1101/2021.12.16.473007

您可以按照以下方式引用 scverse 发表的论文

scverse 项目为单细胞组学数据分析提供了一个计算生态系统

Isaac Virshup,Danila Bredikhin,Lukas Heumos,Giovanni Palla,Gregor Sturm,Adam Gayoso,Ilia Kats,Mikaela Koutrouli,Scverse Community,Bonnie Berger,Dana Pe’er,Aviv Regev,Sarah A. Teichmann,Francesca Finotello,F. Alexander Wolf,Nir Yosef,Oliver Stegle & Fabian J. Theis

Nat Biotechnol. 2023 年 4 月 10 日。doi:10.1038/s41587-023-01733-8

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源分布

anndata-0.10.9.tar.gz (514.2 kB 查看哈希值)

上传时间

构建分布

anndata-0.10.9-py3-none-any.whl (129.0 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

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