3 个项目
foldcomp
Foldcomp 可以有效地压缩蛋白质结构中的扭转角。它将骨架原子压缩到 8 个字节,并将侧链额外压缩到每个残基 4-5 个字节,平均大小的蛋白质(350 个残基)需要 ~4.2kb。Foldcomp 是一个 C++ 库,具有 Python 绑定。
colabfold
使蛋白质折叠对所有人可访问。在 Google Colab 和您的机器上预测蛋白质结构
alphafold-colabfold
AlphaFold v2.3.1 推理管道的实现。这是一个完全新的模型,在 CASP14 中以 AlphaFold2 的形式提交,并在《自然》杂志上发表。本软件包包含对 colabfold 的补丁。