将VCF文件拆分为可理解的制表符分隔文件
项目描述
将VCF文件拆分为可理解的制表符分隔文件。
VCF代表变体调用格式，在生物信息学中被广泛用于保存XX信息，因为它足够灵活，可以存储广泛的数据。尽管它受到CSV文件的启发，以便（我想）使VCF易于人类阅读和机器解析，但它现在在这两方面都做得不太好。它是一种文件格式，其完整规范不能事先给出，因为每个VCF文件都可以自由指定其字段的格式。因此，处理VCF文件中包含的数据的第一步通常是提取其子集，并将提取的数据转换为更易于处理的文件格式。
这个命令行Python包旨在解决上述问题。它将VCF格式拆分为标准的CSV文件，每个文件包含原始VCF文件的不同字段。因此，使它再次易于人类和机器阅读。
安装
假设您有一个最新的Python安装，您将几乎肯定有安装unvcf的所有必要要求。从终端，输入
pip install unvcf用法
安装后，您可以从终端访问unvcf。在这种情况下，您可以使用以下方式开始使用它
unvcf path_to_file.vcf destination_folder/这将生成代表path_to_file.vcf原始字段的CSV文件。如需更多信息，您可以输入
unvcf --help如果您遇到任何问题或有任何疑问，请创建一个新问题，我们将尽快解决。
许可证
本项目受MIT许可证许可。
关闭
unvcf-0.1.2.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | efcea32ea52e79ddd459e801b4abcc28817eb4a05afd187380d9007bf86a4072 |
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| MD5 | 70306e9e11043521a047ef3b00b273e9 |
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| BLAKE2b-256 | 02e34a8b1b09fc0da10a402f9c828d8720f360fd65ec9f3d66eabd8b2b8cf6c9 |