剂量反应曲线和药物诱导增殖（DIP）率拟合及可视化
项目描述
Thunor
Thunor (发音为THOO-nor) 是一个用于管理、可视化和分析高通量筛选（HTS）数据（测量细胞对一个或多个药物的剂量依赖性反应）的免费软件平台。
此存储库，Thunor Core，是一个Python包，可用于独立分析或集成到计算管道中。还有一个围绕此包构建的Web界面，名为 Thunor Web，添加了数据库、多用户功能、拖放上传细胞计数数据、自动计算剂量反应曲线和交互式多面板绘图系统（《演示》）。
实现
Thunor是用纯Python编写的，仅与Python 3兼容。它大量使用 pandas 和 plotly。
安装
Thunor Core已在Python的三个最新稳定版本（目前为3.10-3.12）上进行了测试，因此建议使用其中之一。使用 pip 安装Thunor Core
pip install thunor
示例和文档
Thunor Core文档可在 网上 获取，或者您可以将其本地构建以供离线使用。要这样做，请克隆此git存储库并切换到 thunor 目录。
要本地构建文档，您需要一些软件依赖项
pip install -e '.[docs]'
您还需要安装 pandoc。
然后，您可以按照以下方式构建文档
cd doc
make html
构建完成后，在您的网络浏览器中打开 _build/html/index.html。
教程
与文档一样，您还可以在线查看 教程。要本地操作教程，请根据上一节构建文档。然后，您可以使用Jupyter Notebook打开文件
jupyter notebook --NotebookApp.iopub_data_rate_limit=1.0e10 doc/tutorial.ipynb
引用
卢博克 A.L.R.，哈里斯 L.A.，夸兰塔 V.，泰森 D.R.，洛佩斯 C.F. 《Thunor：高通量剂量-反应数据集的可视化和分析》Nucleic Acids Research (2021), gkab424。
更多帮助和资源
请访问Thunor网站获取更多链接、文档和相关项目。
下载文件
下载适合您平台的文件。如果您不确定该选择哪个，请了解有关安装包的更多信息。
源分发
构建分发
thunor-0.3.0.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 862d1a7dd116e9d8e6b779cbbff084df74533e976a57901e5c042a917c90f08a |
|
| MD5 | 1410055ab2af8e847aed6f4fab14380b |
|
| BLAKE2b-256 | 634aed693fb9a3648f3b8b17c2dfd85da9d2c2d7e5c1000ce8d93ee1d371c3b8 |
thunor-0.3.0-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 8c4cf9206bfffba6c0567ed998a0b527e569170b42cf1355c3984a920002e13e |
|
| MD5 | 51dbe0247bc7af3a9fe8ed79ae1ac63f |
|
| BLAKE2b-256 | 07cbfeef266a44692bb4b7925ba1a4cc08b13ff5199380d00acb50a170717abb |