python 2.7版本的稳定性NMF实现（Siqi Wu 2016年）
项目描述
Amy Campbell, 2016
staNMF
Python 2.7实现Siqi Wu等人的2016稳定性NMF（staNMF）
包内容
staNMF.py
staNMF.py类包含在用户指定的.csv数据集上执行稳定性NMF所需的必要方法（有关精确使用说明，请参阅sourcecode/staNMF_Example）
staNMF_Example.py
staNMF在Wu等人2016年drosophila空间表达数据上的示例，K=15至K=30；生成样本分解，计算不稳定性指数，并绘制不稳定性与K的关系图
staNMF_driver.py
staNMF并行运行的驱动脚本；可以从命令行使用：python staNMF_driver.py <k1> <k2> <reps1> <reps2> <folder> <filename> <function>（请参阅docstring以获取更多具体说明）
data/WuExampleExpression.csv
样本数据集（也可在此下载）
安装
$ pip install staNMF
请注意，staNMF需要SPAMs包（版本2.5），该包可以从 Julien Mairal等人 或通过Anaconda使用
$ conda install -c conda-forge python-spams=2.5
致谢
本工作得到了The Gordon and Betty Moore Foundation的数据驱动发现计划的支持（GBMF 4552至C.S.G.）以及美国国家卫生研究院（R01 CA200854）的资助
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staNMF-1.1.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 6824eb0ef9a82005208eaac3563c00bf19a91b8eb3eb18ab8972e9f5135cf575 |
|
| MD5 | 37c1adf0afeb0296bca15054f6fe6896 |
|
| BLAKE2b-256 | 9175e984b31b4f902646bff1675df4cc391ab84f51464be3fd239509cddbafee |