Python中的空间单细胞分析
项目描述
Squidpy - Python中的空间单细胞分析
Squidpy 是用于空间分子数据分析与可视化的工具。它建立在 scanpy 和 anndata 之上，继承了它们的模块化和可扩展性。它提供利用数据空间坐标的分析工具，以及可选的组织切片图像。
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Squidpy 是 scverse 项目的一部分 (网站，治理)，并由 NumFOCUS 财政支持。请考虑进行可抵税的 捐赠，以帮助项目支付开发者时间、专业服务、差旅、研讨会和各种其他需求。
手稿
请参阅我们在 《Nature Methods》 上的手稿 Palla, Spitzer 等人 (2022) 了解更多信息。
Squidpy 的关键应用
安装
通过运行以下命令安装 Squidpy：
pip install squidpy # or with napari included pip install 'squidpy[interactive]'
或通过 Conda 安装
conda install -c conda-forge squidpy
为 Squidpy 做贡献
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下载文件
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源分布
squidpy-1.6.1.tar.gz (5.9 MB 查看散列值)
构建分布
squidpy-1.6.1-py3-none-any.whl (148.6 kB 查看散列值)
