空间数据的静态绘图。
项目描述
spatialdata-plot: 从SpatialData对象中获取丰富的静态绘图
spatialdata-plot包扩展了spatialdata，提供了一个声明性绘图API，可以快速可视化spatialdata对象及其相应的元素（即images、labels、points和shapes）。
空间数据（SpatialData）的绘图功能允许快速可视化所有包含的模态。用户可以指定哪些元素应被渲染（图像、标签、点、形状）并指定每个层的一些参数，例如例如，根据基因的表达谱来着色形状或为哪个图像通道使用哪种颜色。当最终显示绘图时，所有变换、对齐和坐标系都将在内部处理以形成最终的可视化。根据空间数据的一般理念，所有主要空间技术的所有模态都直接支持。
入门指南
有关 spatialdata-plot 库的更多信息，请参阅文档。特别是，
安装
您需要在系统上安装 Python 3.10 或更高版本。如果您没有安装 Python，我们建议安装 Mambaforge。
有几种安装 spatialdata-plot 的替代选项
- 安装最新开发版本
pip install git+https://github.com/scverse/spatialdata-plot.git@main
联系方式
有关问题和帮助请求，您可以在 scverse 论坛 上进行联系。如果您发现了错误，请使用 问题跟踪器。
引用
Marconato, L.，Palla, G.，Yamauchi, K.A. 等。SpatialData：一个开放和通用的空间组学数据框架。Nat Methods (2024)。 https://doi.org/10.1038/s41592-024-02212-x
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源分发
spatialdata_plot-0.2.6.tar.gz （7.1 MB 查看哈希值）
构建分发
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spatialdata_plot-0.2.6.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 08a4144f6c70a7e7bee66b6487b599414b8e93779abbe81dc22eb98d852bda0f |
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| MD5 | e55580b206ae0618b961f836b3f38334 |
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| BLAKE2b-256 | b02aa35412e3f15463ef543d031fda289b49006a39cc785ab20f1f6199012a29 |