source-mash_plugin_venn：为两个source-mash草图生成简单的Venn图

此插件已弃用。

请使用betterplot插件中的 venn 命令代替，因为截至2024年8月，该插件得到维护和支持。

旧版文档

生成显示DNA或蛋白质序列的两个source-mash草图重叠的Venn图

示例

sourmash scripts venn examples/a.sig.gz examples/b.sig.gz -o a-b.png

sourmash scripts venn examples/a.sig.gz examples/b.sig.gz -o a-b.png --name1 A --name2 B

sourmash scripts venn examples/a.sig.gz examples/b.sig.gz examples/c.sig.gz -o a-b-c.png 

sourmash scripts venn examples/a.sig.gz examples/b.sig.gz examples/c.sig.gz -o a-b-c.png --name1 A --name2 B --name3 C

安装

pip install sourmash_plugin_venn

开发文档

venn 在 https://github.com/sourmash-bio/sourmash_plugin_venn 开发。

测试

运行

pytest tests

生成发布

在pyproject.toml中增加版本号并推送。

在github上创建新的发布。

然后拉取，并

python -m build

接着执行twine upload dist/...。