分子动力学轨迹中溶剂化结构的分析工具。
项目描述
SolvationAnalysis
SolvationAnalysis实现了分析液体溶剂化结构的强大、连贯和快速的方法。它与MDAnalysis集成,可以无缝地计算、查询和可视化溶剂化信息。
在readthedocs上找到文档和教程。
SolvationAnalysis安装
SolvationAnalysis可在PyPI和conda-forge上使用pip或conda安装。
pip install solvation-analysis
# or
conda install -c conda-forge solvation_analysis
Solvation Analysis 概述
可视化
只需几行代码,溶解度分析就可以计算溶剂系统内部和之间的详细性质。以下是一些示例。
贡献
欢迎提交问题和Pull Request(PR)。如果您想做出贡献,请遵循在MDAnalysis行为准则中概述的社区指南。
溶解度分析使用pre-commit进行代码风格检查。如果您正在贡献工作,请确保安装了pre-commit钩子。
引用
本工作已在JOSS中描述,如果您在发表的论文中使用此包,请引用它。
本项目基于Computational Molecular Science Python Cookiecutter版本1.5。