结构化MRI预处理管道
项目描述
SMRIPrep 是一种结构磁共振成像（sMRI）数据处理流程，旨在提供易于访问、技术先进的界面，对扫描采集协议的变化具有鲁棒性，同时需要最少的用户输入，并提供易于理解和全面错误及输出报告。它执行基本处理步骤（如受试者层面平均、B1场校正、空间归一化、分割、颅骨剥离等），提供可轻松连接到后续工具（如 fMRIPrep 或 dMRIPrep）的输出。
工作流程基于 Nipype，结合了来自知名软件包的工具组合，包括 FSL、ANTs、FreeSurfer 和 Connectome Workbench。
更多信息及相关文档可在 https://www.nipreps.org/smriprep/ 查找。支持服务在 neurostars.org 提供。
原则
SMRIPrep 围绕以下三个原则构建
鲁棒性 - 流程根据输入数据集调整预处理步骤，并应提供尽可能好的结果，独立于扫描仪品牌、扫描参数或是否存在附加校正扫描（如场图）。
易用性 - 由于依赖于 BIDS 标准，手动参数输入降至最低，允许流程自动运行。
“透明箱”哲学 - 自动化不应意味着不能直观检查结果或理解方法。因此，SMRIPrep 为每个受试者提供视觉报告，详细说明最重要处理步骤的准确性。这结合文档可以帮助研究人员了解过程并决定哪些受试者应保留用于组水平分析。
致谢
请通过明确提及软件名称（SMRIPrep）和版本，以及链接到 GitHub 仓库 或 Zenodo 参考信息（doi:10.5281/zenodo.2650521）来承认这项工作。
下载文件
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源分布
smriprep-0.16.1.tar.gz (22.5 MB 查看哈希值)
构建分布
smriprep-0.16.1-py3-none-any.whl (19.2 MB 查看哈希值)
