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SimpleITK是Insight Toolkit(ITK)的简化接口,用于图像配准和分割

项目描述

SimpleITK

CircleCI GithubActions ReadTheDocs
发布 CircleCI Batch Build and Test ReadTheDoc
主分支 CircleCI Batch Build and Test ReadTheDoc

SimpleITK是一个图像分析工具包,具有大量组件支持通用滤波操作、图像分割和配准。它基于Insight Segmentation and Registration Toolkit ITK构建,旨在提供对ITK的简化接口。SimpleITK本身是用C++编写的,但适用于大量编程语言。目前,这些包括

C++代码的包装是通过SWIG完成的,原则上,任何SWIG包装的语言都适用于SimpleITK。

与ITK支持的多维时空图像不同,SimpleITK支持2D、3D和4D图像。维数指的是时空维度,体素可以是n维向量。

SimpleITK遵循Apache License

致谢

SimpleITK的开发得到了以下机构的支持

  • 美国国立卫生研究院过敏和传染病研究所的内部研究项目。

  • 美国国立医学图书馆根据美国复苏和再投资法案(ARRA)和美国国立卫生研究院内部研究项目。

  • Insight软件联盟和ITK用户及开发者社区。

许可证和版权

SimpleITK项目是Insight软件联盟(ISC)的一部分,这是一个非营利性教育联盟,致力于推广和维护生物医学图像分析的开放源代码、免费软件。版权由NumFOCUS持有。SimpleITK软件根据Apache License 2.0分发。

如何引用

如果您在研究中发现SimpleITK很有用,请通过引用相关出版物来支持我们的工作

R. Beare, B. C. Lowekamp, Z. Yaniv, "在R中使用SimpleITK进行图像分割、配准和特征描述",J Stat Software,86(8),https://doi.org/10.18637/jss.v086.i08,2018。

Z. Yaniv, B. C. Lowekamp, H. J. Johnson, R. Beare, "SimpleITK图像分析笔记本:一个用于教育和可重复研究的协作环境",J Digit Imaging.,31(3):290-303,https://doi.org/10.1007/s10278-017-0037-8,2018。

B. C. Lowekamp, D. T. Chen, L. Ibáñez, D. Blezek, "SimpleITK的设计",Front. Neuroinform.,7:45。 https://doi.org/10.3389/fninf.2013.00045,2013。

文档

对于像SimpleITK这样的庞大库,良好的文档是必不可少的。SimpleITK的文档分为多个级别

  1. API文档 - 这包含类和函数文档。函数和类的描述主要来自原始ITK C++类。
  2. SimpleITK文档 - 该网站包含高级指南(基本SimpleITK概念、常见约定等)、关于工具包的二进制分发的详细信息、构建工具包的说明以及所有支持的编程语言中的SimpleITK示例。[该网站取代了SimpleITK Wiki,主要出于历史原因。]
  3. Jupyter Notebook仓库 - 该仓库包含用于教育和研究活动的Jupyter Notebook集合,展示了SimpleITK的用法。这些笔记本演示了使用Python和R编程语言进行交互式图像分析。如果您是SimpleITK的新手,这是一份推荐阅读材料。

支持

SimpleITK提供了对ITK大多数组件的访问,但并非全部。如果您正在寻找某些特定内容而找不到,请在GitHub上创建问题或在论坛上寻求支持。

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项目详情


下载文件

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源代码分发

本发布版本没有提供源代码分发文件。请参阅生成分发存档的教程

构建分发

SimpleITK-2.4.0-cp311-abi3-win_amd64.whl (18.7 MB 查看哈希)

上传时间 CPython 3.11+ Windows x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp311-abi3-manylinux_2_17_x86_64.manylinux2014_x86_64.whl (52.3 MB 查看哈希)

上传时间 CPython 3.11+ manylinux: glibc 2.17+ x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp311-abi3-manylinux_2_17_aarch64.manylinux2014_aarch64.whl (47.7 MB 查看哈希)

上传时间 CPython 3.11+ manylinux: glibc 2.17+ ARM64

SimpleITK-2.4.0-cp311-abi3-macosx_11_0_arm64.whl (30.2 MB 查看哈希)

上传时间 CPython 3.11+ macOS 11.0+ ARM64

SimpleITK-2.4.0-cp311-abi3-macosx_10_9_x86_64.whl (44.7 MB 查看哈希)

上传时间 CPython 3.11+ macOS 10.9+ x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp310-cp310-win_amd64.whl (18.6 MB 查看哈希)

上传于 CPython 3.10 Windows x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp310-cp310-manylinux_2_17_x86_64.manylinux2014_x86_64.whl (52.4 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.10 manylinux: glibc 2.17+ x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp310-cp310-manylinux_2_17_aarch64.manylinux2014_aarch64.whl (47.8 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.10 manylinux: glibc 2.17+ ARM64

SimpleITK-2.4.0-cp310-cp310-macosx_11_0_arm64.whl (30.2 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.10 macOS 11.0+ ARM64

SimpleITK-2.4.0-cp310-cp310-macosx_10_9_x86_64.whl (44.7 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.10 macOS 10.9+ x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp39-cp39-win_amd64.whl (18.6 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.9 Windows x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp39-cp39-manylinux_2_17_x86_64.manylinux2014_x86_64.whl (52.4 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.9 manylinux: glibc 2.17+ x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp39-cp39-manylinux_2_17_aarch64.manylinux2014_aarch64.whl (47.8 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.9 manylinux: glibc 2.17+ ARM64

SimpleITK-2.4.0-cp39-cp39-macosx_11_0_arm64.whl (30.2 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.9 macOS 11.0+ ARM64

SimpleITK-2.4.0-cp39-cp39-macosx_10_9_x86_64.whl (44.7 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.9 macOS 10.9+ x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp38-cp38-win_amd64.whl (18.6 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.8 Windows x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp38-cp38-manylinux_2_17_x86_64.manylinux2014_x86_64.whl (52.4 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.8 manylinux: glibc 2.17+ x86-64

SimpleITK-2.4.0-cp38-cp38-manylinux_2_17_aarch64.manylinux2014_aarch64.whl (47.8 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.8 manylinux: glibc 2.17+ ARM64

SimpleITK-2.4.0-cp38-cp38-macosx_11_0_arm64.whl (30.2 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.8 macOS 11.0+ ARM64

SimpleITK-2.4.0-cp38-cp38-macosx_10_9_x86_64.whl (44.7 MB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.8 macOS 10.9+ x86-64

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