阴影

阴影是用于scverse数据标准（如AnnData和MuData）的磁盘接口。

这是一个实验性项目。

安装

pip install shadows
# or
pip install git+https://github.com/scverse/shadows

功能

阴影库旨在实现以下功能

• 阴影对象：只读的 AnnDataShadow 和 MuDataShadow 用于 HDF5 文件。

• AnnDataShadow 和 MuDataShadow 用于 Zarr 文件。

• AnnDataShadow 和 MuDataShadow 用于基于 Parquet 的序列化。

• S3 存储上 Laminate 文件的日期阴影。

阴影对象

示例笔记本 | 更多功能

简而言之，它的工作方式如下

from shadows import *
ash = AnnDataShadow("pbmc3k.h5ad")
msh = MuDataShadow("pbmc5k_citeseq.h5mu")