这是一个辅助工具，用于在rms2d图中找到最小均方根RMSd结构的簇。
项目描述
rms2d 命令在Amber的 cpptraj 中非常有用，可以找到几个结构簇。您可以将轨迹直观地分类到几个结构簇中，并通过找到每个簇中总RMSd值最小的帧来找到每个簇中最稳定的结构。然而，找到具有最小值的 确切 帧号是一个艰巨的任务。
rms2dfinder 将帮助您找到每个簇中具有最小均方根RMSd的帧号。您需要做的只是选择rms2d图上的区域，然后软件会告诉您
最小均方根RMSd（区域内RMSd总和的平均值）
具有最小均方根RMSd的帧号
起始和结束帧号
请参阅下面的截图
安装
使用 pip 安装
pip安装rms2dfinder
需求
它需要 Python 和以下Python库
如果您通过pip安装 rms2dfinder，所有库都将自动安装。
用法
用法：rms2dfinder.py [-h] infile
这是一个辅助工具，用于在rms2d图中找到最小均方根RMSd结构的簇。
位置参数：infile 由Amber的cpptraj中的rms2d命令生成的文件。
可选参数：-h, –help 显示此帮助信息并退出
许可证
MIT许可证 (MIT)
版权所有（C）2014 hashnote.net，Alisue
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rms2dfinder-0.1.2.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 86d250c1c45d5de57786c9a669cf122e3d1a441f2aa9e746fc777ec65e09f523 |
|
| MD5 | f1dae90110bfa31b4040f51bec9d2e84 |
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| BLAKE2b-256 | 8874093a3223d10354e6c7341e3a909d14eb8f36dae2feac2532d5f2abf49364 |
