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Resolwe平台的生物信息学管道

项目描述

Build Status Coverage Status Documentation Status Version on PyPI Supported Python versions

为Django框架的Resolwe数据流包提供的生物信息学管道。

文档与帮助

在[文档](http://resolwe-bio.readthedocs.io/)中了解如何开始以及如何编写[cite]过程。

要与其他开发者聊天或寻求帮助,请加入我们的[Slack](http://resolwe.slack.com/)。

安装

先决条件

确保您的系统已安装Python 3.6。如果您还没有,请遵循[这些说明](https://docs.pythonlang.cn/3/using/index.html)。

Resolwe需要PostgreSQL (9.4+)。许多Linux发行版已经包含了所需的PostgreSQL版本(例如,Fedora 22+,Debian 8+,Ubuntu 15.04+),您可以通过发行版的包管理器轻松安装。否则,请遵循[这些说明](https://wiki.postgresql.ac.cn/wiki/Detailed_installation_guides)。

此外,从PyPI安装一些(间接)依赖项需要系统上安装C编译器(例如,GCC)以及Python开发文件。

注意

首选的安装C编译器和Python开发文件的方式是使用您的发行版的软件包,如果有的话。例如,在基于Fedora/RHEL的系统上,这意味着安装gcc和python3-devel软件包。

使用PyPI

pip install resolwe-bio

要安装预发布版,请使用

pip install --pre resolwe-bio

GitHub上使用源代码

pip install --pre https://github.com/genialis/resolwe-bio/archive/<git-tree-ish>.tar.gz

其中 <git-tree-ish> 可以代表Resolwe生物信息学GitHub存储库中的任何提交SHA、分支名称、标签名称等。例如,要从master分支安装最新的Resolwe生物信息学,请使用

pip install --pre https://github.com/genialis/resolwe-bio/archive/master.tar.gz

贡献

我们欢迎新的贡献者。要了解更多信息,请阅读文档中的[贡献](http://resolwe-bio.readthedocs.io/en/latest/contributing.html)部分。

项目详情


发布历史 发布通知 | RSS源

下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源分发

resolwe-bio-59.1.0.tar.gz (22.5 MB 查看哈希值)

上传时间

构建分发

resolwe_bio-59.1.0-py3-none-any.whl (545.5 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

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