Python Resolwe SDK
项目描述
Resolwe SDK for Python 支持与 Resolwe 服务器及其扩展 Resolwe Bioinformatics 的交互。您可以使用它上传和检查生物医学数据集，贡献注释，运行分析，并编写管道。
文档和帮助
在 文档 中阅读详细描述。
安装
从PyPI安装
pip install resdk
如果您想为SDK代码库做出贡献，请遵循 开发者的安装步骤。
快速入门
在本展示中，我们将从服务器下载对齐读取和它们的索引（BAM和BAI）
import resdk
# Create a Resolwe object to interact with the server
res = resdk.Resolwe(url='https://app.genialis.com')
# Enable verbose logging to standard output
resdk.start_logging()
# Get sample meta-data from the server
sample = res.sample.get('resdk-example')
# Download files associated with the sample
sample.download()两个文件（BAM和BAI）都下载到了工作目录。检查它们。要了解更多关于Resolwe SDK的信息，请继续入门。
如果您无法访问Resolwe服务器，请联系我们 info@genialis.com。
下载文件
下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个，请了解有关 安装包 的更多信息。
源分布
resdk-21.2.0.tar.gz (258.6 kB 查看哈希值)
构建版本
resdk-21.2.0-py3-none-any.whl (85.0 kB 查看哈希值)
关闭
resdk-21.2.0.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | bcf09bc9e2d3c0d306a478ee02e68241f41636193b41c088a6ff77ab5c766d3d |
|
| MD5 | c9a86972d1368bbd2afabed63a861ef4 |
|
| BLAKE2b-256 | 8138b25d3020004eba72cb4b9bf4473a65ed26fb1495a2f094988a0cbfb74b19 |
关闭
resdk-21.2.0-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 34b177abff04451e199782d2a368272c5bf8c0627005c4cd917c8a414c9305b8 |
|
| MD5 | bfc9117a971621207e5ab692e2908aaf |
|
| BLAKE2b-256 | 4f5f345053010072096fdd0b570faec65feea0865ae9daa30b39f9c680ff962b |