更新了relion_it，增加了cryolo包装器
项目描述
relion_it支持crYOLO
relion_it现在使用python 3.6.8运行！在选项中，您可以选择通过crYOLO通用模型或通过relion自动选择器进行选择。CrYOLO在ctfFind之后作为外部作业运行。然后relion会进一步处理crYOLO找到的粒子坐标。粒子在relion GUI中作为手动选择作业出现，并可在此处查看。
外部使用要求
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已安装CrYOLO和Relion 3.0。
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crYOLO和Relion的Conda环境
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编辑options.py中的路径，以指定MotionCor2和Cryolo通用模型的位置
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运行方式:
cryolo_relion_it.py /Path/To/options.py --gui
使用的脚本
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cryolo_relion_it.py：dls_yolo_relion调用的主脚本。这个脚本包含主流程和调用所有其他脚本的代码。
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CryoloPipeline.py：crYOLO流程。作为一个子进程运行，并在收集到新的电影时重复执行许多操作，如导入、运动校正、CTF寻找、crYOLO选择、提取等。由于Relion 3.0不支持外部作业类型，因此YOLO流程实际上是3个独立流程串联在一起。
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CryoloExternalJob.py：读取Relion star文件并创建一个crYOLO可以从中执行颗粒选择的目录。
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CorrectPath.py：在crYOLO选择颗粒后，坐标star文件必须放置在Relion期望的目录树中。这正是这个脚本所做的工作！
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CryoloFineTuneJob.py：在2D分类之后，可以选择好的类别来微调cryolo通用模型。微调后，crYOLO将使用这个新模型在当前运行中选择未来的颗粒。
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options.py：relion_it运行的基本选项。
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qsub.sh：crYOLO的集群提交脚本。
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qtemplate.sh：crYOLO的集群模板。 如果使用集群，必须创建一个'.cry_predict_done'文件，以便管道知道cryolo已经完成。
注意：微调需要在第一次2D迭代后手动选择好的2D类别，可能不会提高选择性能。它被包括为一个实验性功能，不推荐用于实际流程。
下载文件
下载适用于您的平台文件。如果您不确定选择哪个，请了解更多关于安装包的信息。
源分布
构建分布
relion_yolo_it-0.3.0.1.tar.gz的哈希
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 8c775ce008242b83d91a167ae4b235fe17e9fd12c96e6b143cbf7ee6d5cf9f83 |
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| MD5 | 8114da2bede46ced69119b68c36ad716 |
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| BLAKE2b-256 | 27d73ee5250f4ce7bbe2c314bab7dfb9052d040f2dfe76f80e9ffe2a3b8460f1 |
relion_yolo_it-0.3.0.1-py3-none-any.whl的哈希
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 4d15dd66699e4cbb113e65c79f1159a184b217748f15a33ba7b601fad85bbe87 |
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| MD5 | 00d5349250331dcc862a6623e0264352 |
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| BLAKE2b-256 | 44c76ee16ec053e5cfa0d46651876ea22e948169f97040bad049f615ad99837d |
