TRAPI → Cypher transpiler
项目描述
TRAPI → Cypher transpiler
安装
pip install reasoner-transpiler
用法
from reasoner_transpiler.cypher import get_query
qgraph = {
"nodes": {
"diabetes": {
"ids": ["MONDO:0005148"],
},
"phenotype": {
"categories": ["biolink:PhenotypicFeature"],
},
},
"edges": {
"has phenotype": {
"subject": "diabetes",
"predicates": ["biolink:has_phenotype"],
"object": "phenotype",
},
},
}
cypher = get_query(qgraph)
Biolink 模型
此包使用Biolink 模型工具包访问Biolink 模型。您可以选择通过环境变量BL_VERSION使用Biolink 模型的特定版本。否则，将使用Biolink 模型工具包使用的最新版本。
export BL_VERSION=4.1.6
下载文件
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源分发
reasoner_transpiler-2.3.4.tar.gz (27.1 kB 查看哈希值)