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A Python implementation of the preprocessing pipeline (PREP) for EEG data.

项目描述

Python build Python tests codecov Documentation Status PyPI version Conda version Zenodo archive

pyprep

有关文档,请参阅

pyprep 是用于EEG数据的预处理管道(PREP)的Python实现,与 MNE-Python 一起工作。

ALPHA软件。 该包目前处于迭代的早期阶段。 它可能在不久的将来改变其内部结构或用户界面API。 欢迎任何关于如何改进这些方面的反馈和建议! 使用此软件风险自负。

安装

pyprep 需要Python版本 3.8 或更高版本才能正常运行。我们建议在专用虚拟环境中运行 pyprep(例如使用 conda)。

要安装 pyprep稳定版,请执行以下命令:

pip install pyprep

或者,作为 pip 的替代方案,请执行以下命令:

conda install -c conda-forge pyprep

要安装 pyprep最新(开发版),请执行以下命令:

pip install git+https://github.com/sappelhoff/pyprep.git@main

稳定版和最新安装版本都将自动安装所有必要的依赖项。依赖项定义在 setup.cfg 文件下的 options.install_requires 部分。

贡献

我们正在积极寻找贡献者!

请通过在 GitHub 上创建问题或提交拉取请求来提出您如何改进此软件的想法。

有关提交拉取请求的帮助,请参阅我们的 CONTRIBUTING.md 文件。

潜在的贡献者应按照以下方式安装 pyprep

  1. 首先,他们应该将 pyprep 分叉到自己的 GitHub 账户。

  2. 然后,他们应该运行以下命令,并适当替换 <gh-username> 为他们的 GitHub 用户名。

git clone https://github.com/<gh-username>/pyprep
cd pyprep
pip install -r requirements-dev.txt
pre-commit install
pip install -e .

引用

如果您在学术工作中使用此软件,请使用 Zenodo 条目 进行引用。请考虑引用 PREP 的原始出版物(见下文“参考文献”)。元数据编码在 CITATION.cff 文件中。

参考文献

  1. Bigdely-Shamlo, N., Mullen, T., Kothe, C., Su, K.-M., & Robbins, K. A. (2015). The PREP pipeline: standardized preprocessing for large-scale EEG analysis. Frontiers in Neuroinformatics, 9, 16. doi: 10.3389/fninf.2015.00016

项目详情


下载文件

下载适用于您的平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关 安装软件包 的更多信息。

源分布

pyprep-0.4.3.tar.gz (20.1 MB 查看哈希值)

上传时间

构建分布

pyprep-0.4.3-py2.py3-none-any.whl (34.3 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 2 Python 3

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