Python的医学术语:SNOMED CT、ICD10、MedDRA、CDF、UMLS和VCM图标
项目描述
PyMedTermino(Python医学术语)是一个Python模块,用于轻松访问Python中的主要医学术语。以下术语受支持:SNOMED CT、ICD10、MedDRA、CDF、UMLS和VCM图标(巴黎13大学开发的一个标志性术语)。PyMedTermino简化了对术语的访问,但不包括术语内容(除VCM外);术语内容应单独获取(例如,从UMLS下载)。
PyMedTermino是在LIMICS研究实验室,巴黎13大学,索邦巴黎Cité,INSERM UMRS 1142,巴黎6大学,由Jean-Baptiste Lamy创建的。PyMedTermino可在GNU LGPL许可下使用,并在以下科学文章中进行了描述(如果您使用PyMedTermino,请引用它!)
Lamy JB,Venot A,Duclos C. PyMedTermino:一个用于高级术语服务的开源通用API。 Stud Health Technol Inform 2015;210:924-928
如有问题,请联系Jean-Baptiste Lamy <jean-baptiste.lamy@univ-paris13.fr>
LIMICS University Paris 13, Sorbonne Paris Cité Bureau 149 74 rue Marcel Cachin 93017 BOBIGNY FRANCE
我可以使用PyMedTermino做什么?
>>> ICD10.search("tachycardia") [ ICD10[u"I49.5"] # Sick sinus syndrome , ICD10[u"I47.2"] # Ventricular tachycardia , ICD10[u"F43.0"] # Acute stress reaction , ICD10[u"I47"] # Paroxysmal tachycardia , ICD10[u"I47.1"] # Supraventricular tachycardia , ICD10[u"I47.9"] # Paroxysmal tachycardia, unspecified , ICD10[u"R00.0"] # Tachycardia, unspecified , ICD10[u"O68.0"] # Labour and delivery complicated by fetal heart rate anomaly ] >>> ICD10[u"I47"].parents [ICD10[u"I30-I52"] # Other forms of heart disease ] >>> ICD10[u"I47"].children [ ICD10[u"I47.0"] # Re-entry ventricular arrhythmia , ICD10[u"I47.2"] # Ventricular tachycardia , ICD10[u"I47.1"] # Supraventricular tachycardia , ICD10[u"I47.9"] # Paroxysmal tachycardia, unspecified ] >>> list(ICD10[u"I47"].ancestors_no_double()) [ ICD10[u"I30-I52"] # Other forms of heart disease , ICD10[u"IX"] # Diseases of the circulatory system ] >>> ICD10[u"I47"] >> VCM # Maps the ICD10 concept to VCM icon Concepts([ VCM[u"current--hyper--heart_rhythm"] # tachycardia ])
PyMedTermino也可以在没有Python的情况下使用,仅用于将术语内容转换为Sqlite3数据库。
链接
PyMedTermino在BitBucket上(开发仓库): https://bitbucket.org/jibalamy/pymedtermino
PyMedTermino在PyPI(Python包索引,稳定版本): https://pypi.python.org/pypi/PyMedTermino
项目详情
PyMedTermino-0.3.3.tar.gz的散列值
算法 | 散列摘要 | |
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SHA256 | 0f07c6382c5ee91670cf5e3ce3a1648342325c7a4821315c4aa82b19b6b1353b |
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MD5 | bc18b5216c7159362dc3cb469940c4ab |
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BLAKE2b-256 | a57eac9a622ccff56c03f7dd12f0605a782a26343f9dad0d057594432f27db9a |