pydra-templateflow

Pydra的TemplateFlow任务。

Pydra是一个数据流引擎，它提供了一组用于DAG构建、操作和分布式执行的轻量级抽象。

TemplateFlow为公开托管和分发人类和非人类大脑的神经影像学模板提供了一个框架。

目录

• 可用任务
• 安装
• 开发
• 许可证

可用任务

此软件包提供了一个get_template任务，它需要一个必需的template_id参数和一个可选的从输出名称到其相应查询实体的映射output_queries。

以下示例展示了如何使用get_template下载Linear ICBM Average Brain (ICBM152)的模板图像、脑和头部掩膜。

from pydra.tasks import templateflow

task = templateflow.get_template(
    template_id="MNI152Lin",
    output_queries={
        "brain_mask": {"resolution": "1", "suffix": "mask", "desc": "head"},
        "head_mask": {"resolution": "1", "suffix": "mask", "desc": "brain"},
        "t1w_image": {"resolution": "1", "suffix": "T1w"},
    },
)

result = task()

# result.output.brain_mask
# result.output.head_mask
# result.output.t1w_image

请在此处查看可用模板列表 here。

安装

pip install pydra-templateflow

开发

此项目由Hatch管理

pipx install hatch

运行测试套件

hatch run test

修复linting问题

hatch run lint:fix

许可证

本项目遵循Apache License, Version 2.0条款进行分发。