在标准Python 2.7解释器中使用UCSF Chimera Python API。
项目描述
在任何Python 2.7解释器中使用UCSF Chimera包
使用PyChimera,您可以…
使用pychimera script.py从CLI运行依赖于chimera的脚本。
在UCSF Chimera之外,包括IPython和Jupyter笔记本,启用import chimera的交互式编码会话。
使用pychimera --gui启动标准UCSF Chimera实例,并导入所有您的conda或virtualenv包。
希望它对您有用!欢迎提供反馈!
文档
更新的文档始终可在readthedocs找到。
致谢
主要基于chimera-users中的Greg Couch的想法。
引用
PyChimera是科学软件,由公共研究资助(西班牙MINECO的项目CTQ2014-54071-P,加泰罗尼亚政府的项目2014SGR989和研究资助2017FI_B2_00168,COST行动CM1306)。如果您在科学出版物中使用PyChimera,请引用它。这将帮助我们衡量我们研究的影响并确保未来的资金!
@article{pychimera2018,
author = {Rodríguez-Guerra Pedregal, Jaime and Maréchal, Jean-Didier},
title = {PyChimera: use UCSF Chimera modules in any Python 2.7 project},
journal = {Bioinformatics},
volume = {34},
number = {10},
pages = {1784-1785},
year = {2018},
doi = {10.1093/bioinformatics/bty021},
URL = {http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty021},
eprint = {/oup/backfile/content_public/journal/bioinformatics/34/10/10.1093_bioinformatics_bty021/1/bty021.pdf}
}
项目详情
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pychimera-0.2.7.tar.gz的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 03f6153c66360680cf05e17c6e9a8971bb5c9b18ba2f026bcf2e9068ee6f4897 |
|
MD5 | 9eb4d7ff879f8f1f2c56475b7cea9492 |
|
BLAKE2b-256 | 5f75a29597a22ab8b859fb91184285bb59747fd719993af2fca903740dba41f4 |