一个用于使用EBI本体查找服务构建BEL资源文件的包。
项目描述
一个PyBEL[1]扩展，用于使用EBI[2]本体查找服务构建BEL资源。
安装 
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$ pip install git+https://github.com/pybel/pybel-ols.git开发者指南
从GitHub克隆仓库，并使用以下命令以可编辑模式安装：
$ git clone https://github.com/pybel/pybel-ols.git
$ cd pybel-ols
$ pip install -e .入门
主要目标是生成一个命名空间文件。例如，为了生成人类表型本体的命名空间，缩写为前缀hp，可以使用以下命令：
$ pybel-ols namespace_from_ols hp --encoding "O" --output ~/Desktop/hp.belns其中--encoding "O"表示该本体中的所有术语对应于病理/表型BEL类型。
或者，可以使用‘-b’选项指定一个替代的OLS实例。
$ pybel-ols namespace_from_ols hp --encoding O --output ~/Desktop/hp.belns -b https://localhost/ols参考文献
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源代码分发
pybel_ols-0.0.1.tar.gz （10.4 kB 查看哈希值）
构建分发
pybel_ols-0.0.1-py3-none-any.whl （8.2 kB 查看哈希值）
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pybel_ols-0.0.1.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 609a6861bcf2cc22debaf109574432f0a8ae91f6f0c03361d4fbf6cff0792763 |
|
| MD5 | 8e6535ee3622a4d37684b7b0a833bb79 |
|
| BLAKE2b-256 | 9a0ac07b533bdb6a7055b65de5d1cf712c3ca18d623d336ed742103925bd3d48 |
关闭
pybel_ols-0.0.1-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | c95eea119fd575f190931bf3167425bc2498622533e289b0ac7e1b2b108eb01c |
|
| MD5 | 486cfbc248dd125d81bf3600b1a54b66 |
|
| BLAKE2b-256 | abbe8b90e81433468f8aa149b499a4afb8bbbe5d13dc9b538eb086f42e9ebfed |
