PyBEL Git工具
项目描述
为PyBEL提供Git和持续集成工具，以协助编辑BEL。
如果您在您的工作中发现pybel-git很有用，请考虑引用[1]
与持续集成的使用
以下是一些在几个持续集成服务配置中使用pybel-git的示例。另外，可以使用-r选项来指定所需的注释。例如，在重新编辑过程中可以使用-r Confidence。
使用GitHub和Travis-CI
要配置Travis-CI以评估每个提交中GitHub存储库中更改的BEL文件，可以使用以下travis.yml文件
sudo: false
cache: pip
language: python
python:
- '3.7'
install:
- pip install pybel-git
script:
- pybel-git ci目前，构建过程没有使用缓存资源文件，因此这个任务可能需要很长时间。可以使用travis_wait命令，使脚本读取travis_wait 30 pybel-git ci，并且任务将被允许运行三十（30）分钟。
示例仓库可以在https://github.com/cthoyt/pybel-git-test找到。该仓库的示例构建可以在https://travis-ci.cn/cthoyt/pybel-git-test/builds/87612373找到。
使用GitLab与GitLab CI/CD
要配置GitLab CI/CD以评估GitLab仓库中最新提交中更改的BEL文件，可以使用以下.gitlab-ci.yml配置文件
test:
image: python:3.7
script:
- pip install pybel-git
- pybel-git ci与GitHub/Travis-CI类似，此配置不使用缓存资源文件。GitLab CI/CD似乎不提供等待时间，但也可能不存在超时问题。
示例仓库可以在https://gitlab.com/cthoyt/pybel-gitlab-example找到。该仓库的示例构建可以在https://gitlab.com/cthoyt/pybel-gitlab-example/-/jobs/113454179找到
使用Atlassian BitBucket与Bitbucket Pipelines
要配置BitBucket Pipelines以评估BitBucket仓库中最新提交中更改的BEL文件，可以使用以下bitbucket-pipelines.yml配置文件
image: python:3.7
pipelines:
default:
- step:
caches:
- pip
script:
- pip install pybel-git
- pybel-git ci示例仓库可以在https://bitbucket.org/pybel/pybel-bitbucket-example找到。该仓库的示例构建可以在https://bitbucket.org/pybel/pybel-bitbucket-example/addon/pipelines/home#!/results/2找到
与Git服务和持续集成一起使用
与GitLab的深度集成
PyBEL-Git包含额外的脚本，以协助位于GitLab并使用Git Flow分支和合并请求工作流程的项目进行自动检查和反馈。
该脚本会检查每个分支，编译与master相比发生更改的BEL文档，并在合并请求中添加注释，包含对BEL文件的语法和语义正确性的警告和反馈。
它可以这样运行
pybel-git ci_gitlab \
--url "https://gitlab.scai.fraunhofer.de" # the url of the desired gitlab instance \
--project-id 449 # the gitlab project id, shown at the top of the page for the repository \此脚本使用EasyConfig，也可以通过环境变量GITLAB_URL、GITLAB_PROJECT_ID和GITLAB_TOKEN进行配置。
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